More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3433 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3433  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 287 aa  591  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0611  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  52.96 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5381  ApbE family lipoprotein  41.76 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1846  ApbE family lipoprotein  41.76 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000243371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1565  ApbE family lipoprotein  40.22 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  40.91 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1180  ApbE-like lipoprotein  38.75 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0708  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  40.07 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314159  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1800  ApbE family lipoprotein  37.55 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000665627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  33.94 
 
 		 331 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  30.77 
 
 		 351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.03 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  30.67 
 
 		 335 aa  108  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1557  ApbE family lipoprotein  34.19 
 
 		 259 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  32.03 
 
 		 342 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1886  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00789462  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  33.94 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 353 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  32.03 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  32.03 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  35.24 
 
 		 386 aa  99  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  31.52 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  31.06 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  33.2 
 
 		 350 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  30.22 
 
 		 336 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  32.24 
 
 		 344 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3457  ApbE family protein, putative  36.61 
 
 		 281 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0906  ApbE family protein, putative  36.61 
 
 		 281 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00687299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  26.44 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  27.68 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  32.16 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  29.33 
 
 		 345 aa  93.6  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  31.97 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  31.18 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3383  ApbE family lipoprotein  35.52 
 
 		 281 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  31 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0416  ApbE-like lipoprotein  32.21 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00253803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  34.13 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  31.45 
 
 		 349 aa  92  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0921  ApbE family protein, putative  34.97 
 
 		 282 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0949043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  33.2 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3580  ApbE family protein, putative  34.97 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0957  ApbE family protein, putative  34.97 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.76647  normal  0.566735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2856  ApbE family lipoprotein  31.65 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  29.78 
 
 		 355 aa  89.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  30.23 
 
 		 366 aa  89.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  33.83 
 
 		 345 aa  89  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.54 
 
 		 336 aa  89  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  26.79 
 
 		 380 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  35.37 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  27.21 
 
 		 328 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  31.65 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  30.83 
 
 		 345 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  27.42 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  31.03 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  27.48 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  30.18 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0922  ApbE family protein, putative  34.43 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767638  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  29.27 
 
 		 350 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  28.32 
 
 		 348 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  30.69 
 
 		 352 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  30.77 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  31.67 
 
 		 336 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  32.24 
 
 		 333 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  26.97 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  29.51 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  28.3 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  29.96 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  30.25 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  32.06 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  27.78 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.05 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2657  ApbE family protein, putative  30.12 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00549568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1090  ApbE family protein, putative  33.15 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  29.69 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  29 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  31.58 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.71 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  29.51 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  27.69 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1758  ApbE family lipoprotein  27.65 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  34.23 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.9 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  27.41 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  29.39 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  27.34 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  26.64 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  31.73 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  30.96 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.52 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  30.74 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  30.6 
 
 		 365 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  30.97 
 
 		 368 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  32.4 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  31.97 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  28.25 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.81 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  32.53 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>