More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1571 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  100 
 
 
331 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  96.18 
 
 
368 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  95.86 
 
 
365 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  67.21 
 
 
327 aa  374  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  46.38 
 
 
386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  33.73 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  34.42 
 
 
339 aa  172  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.85 
 
 
363 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  38.69 
 
 
369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  32.03 
 
 
338 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.89 
 
 
337 aa  159  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.36 
 
 
336 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  39.62 
 
 
336 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  40.18 
 
 
352 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  37.07 
 
 
351 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  34.89 
 
 
336 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  36.69 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  39.29 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  39.29 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  39.29 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  37.77 
 
 
362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  31.46 
 
 
328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  30.03 
 
 
336 aa  145  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  31 
 
 
348 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  30.61 
 
 
353 aa  143  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  38.67 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  28.71 
 
 
366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  29.75 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.96 
 
 
361 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  37.79 
 
 
362 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  32.03 
 
 
344 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  33.96 
 
 
349 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  27.36 
 
 
309 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  36.28 
 
 
335 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  27.74 
 
 
345 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 
352 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.44 
 
 
357 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 
332 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.89 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  39.79 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  37.19 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.31 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  33.88 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  30.07 
 
 
317 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  33.88 
 
 
338 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  26.67 
 
 
371 aa  135  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  35.68 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  33.22 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  34.48 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  35.4 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  29.81 
 
 
339 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  31.66 
 
 
337 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  35.93 
 
 
332 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  36.96 
 
 
331 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  34.18 
 
 
326 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  30.52 
 
 
360 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.72 
 
 
367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  33.1 
 
 
355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  34.15 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  28.1 
 
 
315 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  34.11 
 
 
342 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  33.56 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  33.56 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  25.48 
 
 
316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  33.44 
 
 
342 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.86 
 
 
349 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  33.12 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  36.27 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  29.23 
 
 
380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  34.17 
 
 
362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30.28 
 
 
343 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  35.53 
 
 
331 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  30.18 
 
 
323 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.62 
 
 
334 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  31.97 
 
 
343 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  30.07 
 
 
379 aa  125  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  35.87 
 
 
341 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  34.81 
 
 
338 aa  123  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  25.58 
 
 
350 aa  123  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  33.33 
 
 
326 aa  123  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  36.12 
 
 
345 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  35.02 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  30.31 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  30.92 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  34.62 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.27 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  32.64 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  30.61 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  27.87 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  33.02 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  35.09 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  30.65 
 
 
332 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.81 
 
 
348 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.24 
 
 
349 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  34.34 
 
 
336 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  30.04 
 
 
329 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  29.38 
 
 
338 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  22.9 
 
 
381 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  36.04 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  31.27 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.481358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>