270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1846 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1846  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 282 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000243371 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5381  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 282 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1180  ApbE-like lipoprotein  55.05 
 
 		 286 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1565  ApbE family lipoprotein  36.4 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0611  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  45.26 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3433  ApbE family lipoprotein  41.76 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  40.45 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0708  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  41.83 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314159  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1800  ApbE family lipoprotein  39.27 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000665627  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2657  ApbE family protein, putative  36.56 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00549568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0957  ApbE family protein, putative  36.17 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.76647  normal  0.566735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0906  ApbE family protein, putative  35.96 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00687299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3457  ApbE family protein, putative  35.96 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0921  ApbE family protein, putative  35.82 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0949043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3383  ApbE family lipoprotein  37.22 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3580  ApbE family protein, putative  36.84 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0922  ApbE family protein, putative  35.82 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767638  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1090  ApbE family protein, putative  34.33 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0416  ApbE-like lipoprotein  31.34 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00253803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1886  ApbE family lipoprotein  35.93 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00789462  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1557  ApbE family lipoprotein  36.79 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  35.23 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  35.84 
 
 		 362 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  31.94 
 
 		 362 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  30.39 
 
 		 351 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  37.02 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  25.52 
 
 		 339 aa  87  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  36.98 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  33.48 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.07 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  29.73 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  31.99 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  28.01 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  29.53 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  26.64 
 
 		 345 aa  79  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  34.84 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  34.84 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  28.69 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  30.59 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.94 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  31.92 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  27.68 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  30.59 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  28.36 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  30.59 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  33.47 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  37.22 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  32.41 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  27.95 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  33.47 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  31.39 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  27.92 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  29.36 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.29 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  26.74 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  26.3 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  26.3 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  31.84 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  26.3 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  26.3 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  30.14 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  29.41 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  26.64 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0909  ApbE family lipoprotein  25.68 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.503634  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  26.04 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  28.42 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  27.08 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  31.1 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  31.21 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  31.1 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  31.1 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  31.62 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  26.39 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.63 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  26.39 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  29.87 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  29.57 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  32.8 
 
 		 386 aa  68.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  28.29 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  33.17 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  31.89 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  33.1 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  27.82 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  26.1 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  27.56 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  28.01 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  34.35 
 
 		 341 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  29.1 
 
 		 345 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.1 
 
 		 331 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  29.39 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  31.4 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  25.87 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  30.04 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  25.69 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  28.46 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  31.33 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  23.86 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  30.52 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.05 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  31.84 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>