More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4425 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 309 aa  580  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  45.67 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  45.55 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2585  ApbE-like lipoprotein  42.16 
 
 		 350 aa  159  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.501359  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  40.31 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  36.11 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  35.88 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  34.15 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  35.57 
 
 		 379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  37.33 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1622  ApbE family lipoprotein  41.94 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.496862  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.46 
 
 		 336 aa  99  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  30.24 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  26.45 
 
 		 336 aa  95.9  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  25.76 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.11 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  32.7 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  33.73 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  27.3 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  33.98 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  27.48 
 
 		 339 aa  90.5  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  28 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  27.24 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  28.26 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  28 
 
 		 349 aa  89  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.75 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  27.84 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  29.14 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  31.92 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  32.45 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  27.67 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  31.92 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  26.32 
 
 		 360 aa  86.7  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  33.08 
 
 		 386 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  28.4 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  28.4 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  35.59 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  26.77 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  28.4 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  26.79 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  27.27 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  26.09 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  34.87 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  27.98 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  26.88 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.52 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  25.82 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0696  ApbE family lipoprotein  25.69 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2080  ApbE family lipoprotein  27.12 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.744114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  26.86 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.52 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.52 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  28.43 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.52 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  27.05 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  30.51 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.14 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  31.78 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  31.27 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.06 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.8 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  28.46 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.27 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  23.79 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  28.79 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  28.79 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  24.03 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5381  ApbE family lipoprotein  32.01 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1846  ApbE family lipoprotein  32.01 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000243371 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.79 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  29.03 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.89 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  26.88 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  27.78 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.03 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.03 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  28.63 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.06 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  24.79 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  26.64 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  26.64 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  27.13 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  26.64 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.56 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.85 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  29.2 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  23.55 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  27.13 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  27.13 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  27.13 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.64 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  27.38 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  28.16 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  23.02 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.47 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  33.94 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  30.29 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  27.71 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  28.06 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>