251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2080 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2080  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 370 aa  770    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.744114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0696  ApbE family lipoprotein  87.43 
 
 		 360 aa  655    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  36.89 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  36.91 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  33.62 
 
 		 316 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  35.14 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  31.69 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  29.49 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  22.9 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  26.33 
 
 		 308 aa  93.2  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  23.94 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  29.67 
 
 		 323 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  25.71 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  27.97 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  25.39 
 
 		 349 aa  85.9  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  29.45 
 
 		 313 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  26.53 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  22.85 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  25.96 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  26.94 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  24.17 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  24.17 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  24.17 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  24.17 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  25.85 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  25.62 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.91 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  28.03 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  28.11 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  23.15 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  27.11 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  25.91 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  27.65 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  27.65 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  28.29 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  28.03 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  25.93 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.98 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  24.5 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  23.47 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  25.51 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  21.43 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  23.86 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  28.91 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  25.52 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  25.29 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  23.86 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  25.41 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.79 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  22.68 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  25.82 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  25.94 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  27.67 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  24.54 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  26.39 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  25.42 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  23.97 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  23.48 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  23.03 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.09 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  24.37 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  24.37 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  23.97 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  25.95 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  23.77 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  23.3 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  23 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  22.97 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  23.69 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  26.61 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  27.67 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.02 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  24.06 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  25.64 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  24.77 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  22.03 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  25.4 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  26.95 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  25.86 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  26.59 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  25.59 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  22.36 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.81 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  24.47 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  21.64 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  24.75 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  26.43 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  27.72 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  24.12 
 
 		 323 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  24.63 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  24.06 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  23.53 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  25.93 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  27.21 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  23.84 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  24.57 
 
 		 362 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.68 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>