More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05200 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  100 
 
 		 332 aa  674    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  44.41 
 
 		 308 aa  252  6e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.68 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  39.93 
 
 		 326 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.87 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  39.33 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  32.62 
 
 		 381 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  32.66 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  33.68 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  37.64 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  31.07 
 
 		 342 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  32.01 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.69 
 
 		 343 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  34.16 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  30.39 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  33.72 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  33.33 
 
 		 348 aa  162  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  37.59 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  34.73 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  33.09 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  29.58 
 
 		 361 aa  155  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  37.36 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  29.08 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  28.42 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  31.77 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  34.16 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.61 
 
 		 363 aa  149  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.01 
 
 		 297 aa  149  8e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  31.72 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  33.68 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  27.15 
 
 		 358 aa  145  8.000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  30.31 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  27.49 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.85 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.96 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  31.56 
 
 		 348 aa  142  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  31.85 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  32.14 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  35 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  32.46 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.06 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  35.69 
 
 		 386 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.4 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  32.97 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  28.72 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  32.08 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  30.92 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  30.43 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  34.39 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  32.47 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  29.75 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  28.01 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  30.9 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  30.89 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  30.34 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  31.52 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  30.4 
 
 		 338 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  28.18 
 
 		 352 aa  132  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  33.33 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  33.48 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.42 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  33.9 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.03 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.12 
 
 		 367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  31.6 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  33.7 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  32.28 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  32.76 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  31.34 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  30.58 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  31.47 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  31.92 
 
 		 332 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  25.41 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  29.35 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  29.52 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  31.67 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  29.29 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  31.71 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  27.88 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  29.15 
 
 		 332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  33.2 
 
 		 349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  31.6 
 
 		 342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  28.93 
 
 		 379 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.89 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  30.36 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  30.77 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.17 
 
 		 337 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  33.71 
 
 		 300 aa  126  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  33.47 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  28.78 
 
 		 332 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  26.92 
 
 		 389 aa  125  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  32.44 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  30.42 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.96 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  30.42 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  29.96 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  30.42 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>