More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1956 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  100 
 
 		 363 aa  742    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  38.66 
 
 		 360 aa  252  6e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  42.77 
 
 		 348 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  40.24 
 
 		 345 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  37.54 
 
 		 353 aa  238  9e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  39.44 
 
 		 339 aa  238  9e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  38.74 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  37.96 
 
 		 380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  37.85 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  42.47 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  41.64 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  36.14 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  37.54 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  34.95 
 
 		 317 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  36.25 
 
 		 336 aa  209  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  36.71 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  34.45 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  32 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.56 
 
 		 336 aa  202  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  38.98 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  36.84 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  34.22 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  38.66 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  36.18 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  43.54 
 
 		 379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  36.28 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  32.38 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  36.16 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  32.48 
 
 		 315 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  34.75 
 
 		 369 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  31.61 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  33.82 
 
 		 339 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  35.09 
 
 		 338 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  33.13 
 
 		 323 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  36.64 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  29.79 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  34.69 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  38.38 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  34.69 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  33.86 
 
 		 344 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.75 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  31.46 
 
 		 358 aa  176  6e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  30.81 
 
 		 361 aa  176  7e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  33.45 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  36.75 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  32.38 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  35.25 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  37.63 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  31.53 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  37.59 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  35.35 
 
 		 339 aa  169  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.35 
 
 		 306 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  33.79 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.29 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.33 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  34.09 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  36.65 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  39.66 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  36.69 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  35.23 
 
 		 308 aa  166  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  36.88 
 
 		 343 aa  165  9e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  34.74 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  33.54 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  37.25 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  31.97 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  34.34 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  35.23 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  34.43 
 
 		 345 aa  159  9e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  35.57 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  33.23 
 
 		 368 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  32.92 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  34.9 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  33.22 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.62 
 
 		 337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.29 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  37.55 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  35.49 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  34.12 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  33.72 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  34.2 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.82 
 
 		 297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.72 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  36.64 
 
 		 310 aa  153  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  29.26 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  32.67 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  28.19 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  37.1 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.66 
 
 		 351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.95 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  30.82 
 
 		 312 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.61 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  29.66 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  29.66 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  29.66 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.66 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.66 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.66 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.29 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>