More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1097 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 339 aa  687    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  39.44 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  41.41 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  34.35 
 
 		 353 aa  215  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  37.01 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  34.26 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  40.78 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  40.78 
 
 		 349 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  36.55 
 
 		 350 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  32.82 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  32.24 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  33.22 
 
 		 381 aa  185  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  32.89 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  31.89 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.66 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  35.35 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  34.16 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  39.51 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  39.39 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  30.43 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  32.24 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.73 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  29.47 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  31.43 
 
 		 366 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  33.11 
 
 		 351 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.28 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  33.55 
 
 		 371 aa  163  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  35.08 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  34.36 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.16 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  31.97 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  31.38 
 
 		 346 aa  155  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  30.87 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  30.09 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  30.69 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  30.09 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  32.67 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  35.92 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  31.39 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  31.82 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  32.34 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  31.41 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  34.59 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  34.76 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  33.46 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  31.67 
 
 		 344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  33.22 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.93 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  33.85 
 
 		 291 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  37.18 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  31.79 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  31.05 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.37 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  32.09 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  31.21 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.27 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  28.88 
 
 		 352 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  30.23 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.46 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  33.96 
 
 		 348 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  35.15 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.26 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  32.09 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  28.34 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  31.46 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  31.73 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  34.2 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  28.62 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  32.08 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  32.92 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  32.09 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  33.62 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.15 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  31.78 
 
 		 345 aa  143  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  33.06 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  29.07 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  31 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  32.2 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  31.76 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  33.48 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.41 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  28.53 
 
 		 329 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  31.16 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  33.85 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  33.48 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  33.91 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.12 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  33.48 
 
 		 301 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  32.84 
 
 		 338 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  32.1 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  31.74 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.12 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  30.63 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  33.08 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  32.19 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.12 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>