More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2614 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  100 
 
 		 371 aa  749    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  35.21 
 
 		 380 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  36.31 
 
 		 345 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  39.43 
 
 		 360 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  35.93 
 
 		 366 aa  205  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  40.93 
 
 		 348 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.22 
 
 		 363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  40.49 
 
 		 350 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  33.33 
 
 		 342 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  41.43 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.8 
 
 		 343 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  35.26 
 
 		 323 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  32.82 
 
 		 353 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  39.39 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  37.15 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  32.66 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  34.66 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  38 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  32.32 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  38.46 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  34.19 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  38.46 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  38.72 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  32.02 
 
 		 346 aa  169  6e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  31.33 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.82 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  35.2 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  36.92 
 
 		 323 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  34.58 
 
 		 386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  31.17 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  38.96 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  35.04 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  36.51 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  33.55 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  37.93 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  38.84 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  37.93 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  31.72 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  37.95 
 
 		 379 aa  159  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  35.12 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.85 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  35.94 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.47 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  32.96 
 
 		 351 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  30.56 
 
 		 315 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  28.47 
 
 		 316 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  28.62 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  33.19 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  35.25 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  31.73 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  34.54 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.73 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.77 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  32.92 
 
 		 344 aa  146  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.93 
 
 		 361 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.32 
 
 		 349 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.2 
 
 		 306 aa  145  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  30.95 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  27.49 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  28.81 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.63 
 
 		 351 aa  142  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  28.66 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  26.13 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  29.68 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.7 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  35.78 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  32.18 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.03 
 
 		 351 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.96 
 
 		 351 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.96 
 
 		 351 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  35.06 
 
 		 350 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  28.96 
 
 		 351 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  28.96 
 
 		 351 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  28.96 
 
 		 351 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.96 
 
 		 351 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.67 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.94 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.86 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  31.25 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.59 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.62 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  30.12 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.83 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.94 
 
 		 350 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.94 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  29.96 
 
 		 343 aa  135  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  29.97 
 
 		 359 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  30.12 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  29.97 
 
 		 345 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.94 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  33.33 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  34.15 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  30.79 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.94 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  30.92 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  27.44 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  29.39 
 
 		 335 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  27.08 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>