More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4038 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 386 aa  757    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  41.64 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  42.81 
 
 		 336 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  38.33 
 
 		 348 aa  217  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  43.48 
 
 		 351 aa  215  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  44.88 
 
 		 365 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  45.07 
 
 		 331 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  44.55 
 
 		 368 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  43 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  36.96 
 
 		 348 aa  203  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  32.41 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  36.07 
 
 		 345 aa  202  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  44.84 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  37.04 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  37.29 
 
 		 353 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  39.68 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  38.38 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  32.89 
 
 		 316 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  33.43 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  34.63 
 
 		 360 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  34.75 
 
 		 317 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  31.43 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  30.42 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  34.39 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  32.89 
 
 		 309 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  34.18 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 315 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  38.36 
 
 		 331 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  31.09 
 
 		 361 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  31.35 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  39.68 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  38.46 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  41.22 
 
 		 308 aa  176  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  36.97 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  38.73 
 
 		 362 aa  173  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  36.49 
 
 		 308 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  37.79 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  36.19 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  37.34 
 
 		 335 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  37.62 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.06 
 
 		 343 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  30.9 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  33.69 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  33.69 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  33.88 
 
 		 323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  36.88 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  32.78 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  33 
 
 		 339 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.45 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  39.16 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  38.78 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  35.65 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  32.34 
 
 		 323 aa  159  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  30.87 
 
 		 320 aa  159  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  34.9 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.39 
 
 		 361 aa  157  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  32.34 
 
 		 323 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  35.6 
 
 		 355 aa  156  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  28.52 
 
 		 358 aa  156  6e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  32.47 
 
 		 343 aa  155  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.81 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.62 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  32.13 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  30.68 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  36.39 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  35.62 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  36.33 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  34.69 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  30.77 
 
 		 353 aa  150  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.2 
 
 		 320 aa  149  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  37.2 
 
 		 344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  35.53 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  38.81 
 
 		 345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  35.43 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  31.91 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  35.44 
 
 		 350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  37.14 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.76 
 
 		 349 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  30.04 
 
 		 370 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  33.88 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  35.34 
 
 		 332 aa  143  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  34.59 
 
 		 350 aa  143  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  39.19 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  37.09 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  34.92 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  35.15 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  35.56 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  35.56 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  35.56 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  34.86 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  31.35 
 
 		 346 aa  140  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.42 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  34.13 
 
 		 362 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.63 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  35.71 
 
 		 310 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  25.5 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  29.84 
 
 		 333 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.04 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>