More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2411 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  53.97 
 
 		 322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  48.12 
 
 		 306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  47.04 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  39.64 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  39.44 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2333  ApbE family lipoprotein  39.66 
 
 		 319 aa  198  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00261528  normal  0.177607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  38.1 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  40.44 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  41.07 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  37.93 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  39.56 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  39.56 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  39.67 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  38.55 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  38.83 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  38.66 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  38.18 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  38.18 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  38.18 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  34.48 
 
 		 335 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  37.92 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  36.5 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  31.36 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  37.97 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  37.33 
 
 		 330 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  34.78 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  33.45 
 
 		 350 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  33.7 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  33.58 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  32.57 
 
 		 328 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  34.57 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.71 
 
 		 363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  29.89 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  32 
 
 		 381 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  32.48 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  36.56 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  34.63 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  32.15 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  31.72 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  31.96 
 
 		 380 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  35.31 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.2 
 
 		 306 aa  139  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  37 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  35.9 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  35 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  36.33 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  31.66 
 
 		 339 aa  132  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.25 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  34.96 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  35.02 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  35.69 
 
 		 386 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.04 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  31.6 
 
 		 353 aa  129  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  28.24 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  31.71 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  34.96 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  33.71 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  34.26 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  31.74 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  31.06 
 
 		 350 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 332 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  33.05 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  29.75 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.33 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  30.53 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  38.5 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  33.05 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  31.28 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  28.57 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  35.29 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  32.84 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  37.27 
 
 		 340 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  29.89 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  33.56 
 
 		 344 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  29.37 
 
 		 344 aa  122  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  32.3 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  30.04 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  29.01 
 
 		 338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  34.29 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  30.26 
 
 		 336 aa  119  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  32.58 
 
 		 347 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.37 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  34.15 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2402  ApbE family lipoprotein  32.69 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.29 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  32.33 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  37.1 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  27.57 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  31.91 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  31.68 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.28 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  29.45 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  33.2 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1534  ApbE family lipoprotein  38.63 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.97 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  31.67 
 
 		 338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>