More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3407 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 297 aa  622  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  58.78 
 
 		 300 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  58.45 
 
 		 300 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  58.11 
 
 		 301 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  58.45 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  59.18 
 
 		 304 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  58.11 
 
 		 300 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  58.11 
 
 		 301 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  57.77 
 
 		 301 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  57.19 
 
 		 298 aa  360  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  58.99 
 
 		 275 aa  346  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  57.19 
 
 		 275 aa  338  8e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  50.55 
 
 		 279 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  47.02 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  45.18 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  44.97 
 
 		 304 aa  235  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  42.11 
 
 		 305 aa  235  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  43.21 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2333  ApbE family lipoprotein  43.73 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00261528  normal  0.177607 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  37.77 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  36.71 
 
 		 312 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  36.24 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  36.5 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  32.58 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  32.26 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  32.92 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  33.83 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  32.77 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  30.22 
 
 		 349 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  30.22 
 
 		 349 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.51 
 
 		 341 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.39 
 
 		 349 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  30.38 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  30.25 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  30.38 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  30.38 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  31.23 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  30.38 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  27.56 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  31.53 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  33.33 
 
 		 348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  30.86 
 
 		 381 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  31.38 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  35.02 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  30.92 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  31.99 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.54 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  32.22 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  29 
 
 		 353 aa  116  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  29.26 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  29.91 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  28.8 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  33.06 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  37.21 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  29.87 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  29.06 
 
 		 360 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  32.49 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  29.59 
 
 		 374 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  32.34 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.42 
 
 		 343 aa  112  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.3 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  28.91 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  30.35 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  29.78 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 		 374 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.39 
 
 		 367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  30.58 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  30.57 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  30.4 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  31.36 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.57 
 
 		 347 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  33.63 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  29.03 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  31.95 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  30.6 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  31.95 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.95 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  30.94 
 
 		 379 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  32.02 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  33.19 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.4 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.17 
 
 		 350 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  28.2 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  30.64 
 
 		 417 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  32 
 
 		 349 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  35.24 
 
 		 348 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.02 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  29.04 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  29.1 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  31.13 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  29.75 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  29.75 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  28.52 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  31.39 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  29.02 
 
 		 371 aa  99.8  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.05 
 
 		 349 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>