More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1216 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  99.14 
 
 		 349 aa  708    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 349 aa  712    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  46.73 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  45.29 
 
 		 343 aa  291  9e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  45.05 
 
 		 345 aa  249  7e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  43.49 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.66 
 
 		 363 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  38.12 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  40.21 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  37.93 
 
 		 348 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  37.54 
 
 		 353 aa  179  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  37.46 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  37.11 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  34.66 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  35.59 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  34.62 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  31.53 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  37.93 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  36.62 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  36.26 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  37.25 
 
 		 381 aa  155  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  36.27 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  38.82 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  33.2 
 
 		 279 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  41.59 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  39.29 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  32.9 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  34.38 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  32.58 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  37.99 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  32.8 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  32.15 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  38.25 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  35.97 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  34.92 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  31.63 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.33 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  36.78 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  33.1 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  37.9 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  37.34 
 
 		 298 aa  142  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  31 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  30.12 
 
 		 366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.98 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  36.67 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  32.2 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  36.95 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  32.87 
 
 		 301 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  37.1 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  33.6 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  34.6 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  36.65 
 
 		 344 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  32.87 
 
 		 301 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  35.17 
 
 		 300 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  32.71 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  32.87 
 
 		 301 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  30.22 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  31.35 
 
 		 346 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  33.58 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  28.75 
 
 		 358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  33.58 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  34.88 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  32.3 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  35.34 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  33.06 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  30.63 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  30.31 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  30.72 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  34.62 
 
 		 275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  30.72 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  33.58 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  30.99 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  30.04 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  31.06 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  34.88 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  30.72 
 
 		 352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  32.12 
 
 		 369 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  30.22 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  34.14 
 
 		 345 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  30.34 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  31.76 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  27.88 
 
 		 308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  37.34 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  35.48 
 
 		 370 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  31.39 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.83 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.97 
 
 		 349 aa  126  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  32.5 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  32.58 
 
 		 340 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  33.2 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  34.58 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  30.97 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  30.97 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.36 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  33.76 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  31.37 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  35.61 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  35.61 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  29.03 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  36.77 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>