More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1651 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 306 aa  604  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  48.12 
 
 		 305 aa  288  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2333  ApbE family lipoprotein  48.22 
 
 		 319 aa  280  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00261528  normal  0.177607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  46.98 
 
 		 279 aa  255  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  46.23 
 
 		 298 aa  252  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  47.02 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  45.86 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  45.86 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  45.52 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  45.52 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  45.52 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  45.52 
 
 		 302 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  47.9 
 
 		 300 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  47.69 
 
 		 304 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  47.35 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  44.7 
 
 		 304 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  46.42 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  47.04 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  45.23 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  45.1 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  39.45 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  42.12 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  36.67 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  38.46 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  35.9 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  40.41 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  34.88 
 
 		 349 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  34.88 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  32.77 
 
 		 339 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  34.2 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  34.67 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.37 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  32.22 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  30.62 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  31.01 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  31.64 
 
 		 353 aa  122  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  35.66 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  28.77 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  34.53 
 
 		 369 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  28.69 
 
 		 350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  30.83 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  35.1 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  31.73 
 
 		 370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  31.54 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  34.01 
 
 		 344 aa  116  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  32.32 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.39 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.42 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  36.18 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  32.42 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  32.42 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.82 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  36.59 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  29.54 
 
 		 381 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  35.74 
 
 		 351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  35.63 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  35.5 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  35.89 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  39.15 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  36.36 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  31.75 
 
 		 338 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  34.66 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  34.66 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.83 
 
 		 349 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  31.98 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  35.25 
 
 		 362 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  33.04 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  29.48 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  34.15 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  34.75 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  29.29 
 
 		 343 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  32.39 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  30.89 
 
 		 337 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.04 
 
 		 343 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  29.12 
 
 		 348 aa  105  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  34.36 
 
 		 350 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  31.3 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  30.86 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  30.86 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  30.86 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  30.86 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  28.03 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  34.36 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  34.36 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  34.36 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.2 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  35.63 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.16 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  30.16 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  29.22 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  34.02 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  30.04 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  27.91 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  31.3 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.22 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  32.27 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  31.54 
 
 		 341 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  29.75 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  30.2 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>