More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0673 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
345 aa  696    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  48.39 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  46.15 
 
 
366 aa  333  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  46.11 
 
 
360 aa  322  7e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  46.93 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  42.82 
 
 
381 aa  287  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  41.74 
 
 
380 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  42.3 
 
 
358 aa  277  2e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  43.6 
 
 
350 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  46.83 
 
 
323 aa  268  8e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  44.21 
 
 
323 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  38.92 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  40.51 
 
 
361 aa  251  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  43.36 
 
 
323 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  43.66 
 
 
325 aa  245  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  41.46 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  43.71 
 
 
321 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  41.04 
 
 
343 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  41.42 
 
 
308 aa  229  7e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  39.94 
 
 
339 aa  227  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  39.46 
 
 
323 aa  225  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  40.83 
 
 
297 aa  225  9e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  37.22 
 
 
330 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  37.46 
 
 
312 aa  218  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  36.31 
 
 
371 aa  212  9e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  38.98 
 
 
305 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  39.78 
 
 
320 aa  210  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  40.96 
 
 
308 aa  207  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  39 
 
 
325 aa  203  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  39.78 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  35.82 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  35.95 
 
 
317 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  41.38 
 
 
306 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  38.27 
 
 
386 aa  199  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  34.38 
 
 
335 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  36.93 
 
 
350 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  34.15 
 
 
331 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  35.77 
 
 
328 aa  192  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  35.25 
 
 
326 aa  192  8e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  32.82 
 
 
339 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  36.96 
 
 
315 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  36.59 
 
 
309 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  36.63 
 
 
379 aa  186  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  33.33 
 
 
355 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  35.28 
 
 
336 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.46 
 
 
313 aa  181  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  34.64 
 
 
351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  34.87 
 
 
336 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.66 
 
 
332 aa  179  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  37.55 
 
 
336 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  35.02 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  35.02 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  36.19 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.01 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  34.4 
 
 
369 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  34.81 
 
 
340 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  35.24 
 
 
337 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  37.23 
 
 
338 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  36.69 
 
 
350 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.77 
 
 
320 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.9 
 
 
349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  32.58 
 
 
349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  33.7 
 
 
308 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  35.25 
 
 
344 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  35.42 
 
 
348 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  36.97 
 
 
349 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  36.62 
 
 
349 aa  159  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  33.22 
 
 
345 aa  159  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  36.78 
 
 
389 aa  159  8e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  32.11 
 
 
346 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  33.73 
 
 
306 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
338 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  35.23 
 
 
343 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.11 
 
 
337 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  32.57 
 
 
338 aa  156  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.99 
 
 
350 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.21 
 
 
347 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  36.08 
 
 
350 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  31.34 
 
 
362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.23 
 
 
349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  36.04 
 
 
362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  30.33 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  32.08 
 
 
338 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.53 
 
 
361 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  31.8 
 
 
348 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  31.8 
 
 
348 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  31.8 
 
 
348 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  31.8 
 
 
348 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  30.25 
 
 
374 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.69 
 
 
334 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  30.87 
 
 
347 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.94 
 
 
341 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  31.27 
 
 
370 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  32.95 
 
 
379 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  34.13 
 
 
370 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  31.15 
 
 
374 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  31.27 
 
 
352 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  31.27 
 
 
352 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>