More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1523 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 350 aa  721    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  51.9 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  46.54 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  41.72 
 
 		 360 aa  282  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  43.6 
 
 		 345 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  40.54 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  40.3 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  40 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  39.44 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  38.24 
 
 		 381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  34.19 
 
 		 339 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  35.5 
 
 		 323 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  32.05 
 
 		 353 aa  209  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  36.25 
 
 		 325 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  35.84 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  40.49 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  41.09 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  35.23 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  36.55 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  33.01 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  34.71 
 
 		 379 aa  186  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  33.65 
 
 		 361 aa  185  8e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  32.68 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  31.92 
 
 		 386 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  37.8 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  34.53 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  32.04 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  32.12 
 
 		 312 aa  178  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  37.11 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  32.89 
 
 		 305 aa  176  8e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  32.09 
 
 		 326 aa  172  7.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  33.13 
 
 		 355 aa  172  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  34.42 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  33.46 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  34.63 
 
 		 350 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  32.35 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  35.35 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.29 
 
 		 297 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  35.34 
 
 		 308 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  30.84 
 
 		 346 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  29.48 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  34.31 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  31.21 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.34 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.72 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  35.25 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  31.73 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  31.6 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  31.31 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  29.22 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.39 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.93 
 
 		 313 aa  156  6e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  30.98 
 
 		 350 aa  155  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  33.45 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  29.11 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  31.69 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  30.67 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  31.37 
 
 		 308 aa  153  5e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  30.25 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.31 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  35.24 
 
 		 348 aa  152  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  29.49 
 
 		 350 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  29.9 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  33.9 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  31.87 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.19 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  30.18 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  29.87 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  31.99 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  29.33 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  29.86 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.74 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  30.45 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  30.98 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30.32 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  29.2 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  32.78 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  28.4 
 
 		 338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  29.87 
 
 		 329 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  30.23 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  27.85 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  28.31 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  31.46 
 
 		 344 aa  142  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  26.35 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.61 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  30.04 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.76 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.55 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  29.33 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  30.63 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  31.11 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  30.55 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  30.55 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  27.17 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  28.53 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.27 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  31.13 
 
 		 279 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  30.43 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>