More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0414 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  100 
 
 		 325 aa  663    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  51.79 
 
 		 308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  47.68 
 
 		 308 aa  289  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  43.67 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  44.85 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  45.3 
 
 		 297 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  42.42 
 
 		 323 aa  235  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  43.14 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  43.66 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  42.54 
 
 		 312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  43.24 
 
 		 321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  41.46 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  39.5 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  41.03 
 
 		 381 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  41.09 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  39 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  35.02 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  34.29 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  32.66 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  34.42 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  31.89 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  31.19 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  32.69 
 
 		 366 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  33.77 
 
 		 348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  31.4 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  32.37 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  28.85 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.64 
 
 		 343 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  31.77 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  31.44 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.41 
 
 		 313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.62 
 
 		 363 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  34.73 
 
 		 309 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  28.53 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.04 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  29.59 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  30.53 
 
 		 339 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  30.38 
 
 		 389 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.57 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  32.13 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  30.56 
 
 		 317 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  32.27 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  30.92 
 
 		 346 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  31.56 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  28.46 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  26.17 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  28.8 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.68 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  31.03 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.01 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  32.74 
 
 		 339 aa  112  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  27.09 
 
 		 379 aa  112  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  31.03 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  28.63 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  32.07 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  31.65 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  31.78 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  29.82 
 
 		 346 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  29.82 
 
 		 346 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  29.34 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  28.62 
 
 		 350 aa  109  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  27.67 
 
 		 362 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  28.25 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  26.79 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  28.99 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  29.33 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  28.63 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  29.82 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.97 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  28.98 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  27.17 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  28.28 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  30.15 
 
 		 349 aa  102  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.33 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  28.18 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  28.85 
 
 		 344 aa  99.4  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  28.4 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  31.6 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1971  ApbE family lipoprotein  25.52 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.196908 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  29.84 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  26.45 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  24.72 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  22.66 
 
 		 331 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  23.3 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  28.46 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2280  ApbE family lipoprotein  29.63 
 
 		 372 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.506741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2090  ApbE family lipoprotein  27.01 
 
 		 427 aa  95.9  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  22.94 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  27.92 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  28.46 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  29.57 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  24.35 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.84 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  30.67 
 
 		 370 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  29.68 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  29.03 
 
 		 353 aa  93.6  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  26.62 
 
 		 299 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  30.65 
 
 		 298 aa  92.8  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  26.42 
 
 		 350 aa  92.4  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>