More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0788 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  100 
 
 		 297 aa  609  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  57.5 
 
 		 320 aa  328  6e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  53.45 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  46.05 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  45.3 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  42.23 
 
 		 305 aa  238  8e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  45.19 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  41.64 
 
 		 325 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  41.92 
 
 		 342 aa  229  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  43.58 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  40.83 
 
 		 345 aa  225  7e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  43.87 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  42.11 
 
 		 323 aa  221  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  42.52 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  35.15 
 
 		 361 aa  199  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  36.99 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  39.84 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  37.08 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  32.65 
 
 		 358 aa  182  6e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  39.39 
 
 		 371 aa  179  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  34.98 
 
 		 360 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  34.04 
 
 		 353 aa  178  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  33.1 
 
 		 348 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  35.09 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  32.29 
 
 		 350 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  31.07 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.62 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  32.28 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.58 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.82 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  30.56 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.67 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.01 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  28.62 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  33.57 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  31.36 
 
 		 369 aa  139  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  34.67 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  29.14 
 
 		 389 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  31.9 
 
 		 316 aa  135  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  33.07 
 
 		 350 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  34.63 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  32.84 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  34.7 
 
 		 350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.5 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  30.66 
 
 		 336 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  33.59 
 
 		 339 aa  122  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  28.62 
 
 		 343 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  27.93 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  27.7 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  27.5 
 
 		 362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.91 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  30.97 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.96 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  30.92 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  27.8 
 
 		 351 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.91 
 
 		 351 aa  118  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.91 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  26.98 
 
 		 362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.57 
 
 		 351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  24.57 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  24.57 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.43 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.57 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  24.57 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.57 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.43 
 
 		 350 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  33.18 
 
 		 340 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  31.7 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.89 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.09 
 
 		 350 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.09 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.09 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  28.51 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  29.63 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  27.52 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  29.59 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.64 
 
 		 361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.15 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.99 
 
 		 348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  26.95 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.41 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  27.43 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  26.83 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  26.83 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  25.89 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.63 
 
 		 348 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  29.39 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.34 
 
 		 351 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  27.49 
 
 		 355 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2280  ApbE family lipoprotein  26.99 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.506741 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.96 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2090  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 427 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  27.37 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.25 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1971  ApbE family lipoprotein  30.53 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.196908 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  30.59 
 
 		 349 aa  106  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 348 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  28.83 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  29.84 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>