More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1601 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  100 
 
 
358 aa  729    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  44.06 
 
 
342 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  42.3 
 
 
345 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  42.38 
 
 
361 aa  275  9e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  38.1 
 
 
360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  36.71 
 
 
366 aa  229  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  36 
 
 
348 aa  226  7e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  36.33 
 
 
323 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  34.17 
 
 
381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  34.46 
 
 
325 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  34.8 
 
 
323 aa  209  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  35.84 
 
 
350 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  31.92 
 
 
380 aa  205  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  39.38 
 
 
308 aa  205  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  36.04 
 
 
312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  37.32 
 
 
308 aa  194  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  34.29 
 
 
325 aa  193  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  34.06 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
323 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  32.55 
 
 
305 aa  187  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  32.71 
 
 
323 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  31.01 
 
 
330 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.65 
 
 
297 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.21 
 
 
343 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  28.14 
 
 
353 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.46 
 
 
363 aa  176  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  31.29 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  32.52 
 
 
371 aa  172  7.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  31.83 
 
 
317 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  34.43 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  30.28 
 
 
339 aa  166  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  31.91 
 
 
339 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.56 
 
 
306 aa  155  8e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  31.82 
 
 
339 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.62 
 
 
313 aa  152  8.999999999999999e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  30.16 
 
 
316 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  27.71 
 
 
386 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  29.55 
 
 
315 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  29.41 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  30.46 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  28.24 
 
 
350 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  28.76 
 
 
326 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  29.22 
 
 
351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  27.93 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.15 
 
 
332 aa  139  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  26.69 
 
 
328 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  33.2 
 
 
350 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  28.47 
 
 
308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  27.68 
 
 
335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  29.08 
 
 
346 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.55 
 
 
336 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  27.02 
 
 
379 aa  133  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  29.45 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  29.45 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.03 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  33.33 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  30.38 
 
 
336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  27.76 
 
 
344 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  28.83 
 
 
308 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  27.46 
 
 
348 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  28.24 
 
 
340 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  27.84 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  30.04 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  27.84 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  26.8 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.75 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  27.06 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  28.89 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  29.63 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.4 
 
 
337 aa  119  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  26.24 
 
 
327 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  26.8 
 
 
321 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  23.45 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  29.88 
 
 
332 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  29.21 
 
 
343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  23.45 
 
 
368 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  23.13 
 
 
331 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.42 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  25.16 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  28.12 
 
 
345 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  29.8 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  25.81 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  26.34 
 
 
362 aa  110  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  25.89 
 
 
337 aa  109  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  27.67 
 
 
355 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.64 
 
 
343 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  30.34 
 
 
351 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  27.92 
 
 
333 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.17 
 
 
349 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  27.61 
 
 
337 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  27.87 
 
 
344 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  29.11 
 
 
306 aa  106  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.35 
 
 
349 aa  106  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  23.17 
 
 
331 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  25.26 
 
 
327 aa  105  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.44 
 
 
341 aa  105  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  28.16 
 
 
321 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  28.26 
 
 
349 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  25.19 
 
 
334 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>