More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0936 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
349 aa  687    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  43.17 
 
 
350 aa  255  9e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  42.9 
 
 
347 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  37.11 
 
 
346 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  35.17 
 
 
351 aa  202  7e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  39.38 
 
 
362 aa  202  8e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  39.68 
 
 
344 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  38.78 
 
 
352 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  37.39 
 
 
370 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  37.39 
 
 
352 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  39.29 
 
 
352 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2402  ApbE family lipoprotein  37.11 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  41.76 
 
 
291 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3926  ApbE family lipoprotein  41.36 
 
 
366 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166642  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  33.33 
 
 
348 aa  169  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3188  ApbE family protein  41.05 
 
 
524 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3187  positive regulator of sigma E, RseC/MucC  40.32 
 
 
365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.981913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  37.98 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.44 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  34.49 
 
 
353 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  36.36 
 
 
343 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  33.66 
 
 
335 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.07 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  36.75 
 
 
331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  35.19 
 
 
351 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  28.45 
 
 
360 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  35.69 
 
 
349 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  35.34 
 
 
349 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  27.67 
 
 
350 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  33.63 
 
 
379 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  30.14 
 
 
345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  29.94 
 
 
339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  34.4 
 
 
353 aa  139  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  34.75 
 
 
336 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  28.01 
 
 
380 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  31.36 
 
 
348 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  31.44 
 
 
369 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  31.53 
 
 
344 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  30.84 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  35.25 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  32.26 
 
 
345 aa  132  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  30.16 
 
 
338 aa  132  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0511  ApbE family lipoprotein  26.76 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  29.71 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  29.02 
 
 
346 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  36.19 
 
 
339 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  30.67 
 
 
370 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  34.47 
 
 
368 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  32.65 
 
 
346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  32.65 
 
 
346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  28.9 
 
 
366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  33.9 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  31.09 
 
 
371 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.2 
 
 
306 aa  127  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  38.61 
 
 
327 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  31.53 
 
 
336 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  34.94 
 
 
308 aa  126  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  33.99 
 
 
340 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  29.48 
 
 
343 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  25.9 
 
 
342 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  29.56 
 
 
333 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  33.18 
 
 
317 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  27.83 
 
 
336 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.55 
 
 
336 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  30.9 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  32.21 
 
 
389 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  28.98 
 
 
316 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  26.06 
 
 
361 aa  120  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  32.41 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  33.67 
 
 
344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  32.65 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  31.27 
 
 
310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.29 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  30.26 
 
 
344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.97 
 
 
357 aa  116  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  28.1 
 
 
336 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  33.86 
 
 
323 aa  116  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  28.62 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  30.15 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.5 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  34.84 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  34.38 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  26.26 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.57 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  27.22 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  24.5 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  31.04 
 
 
349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  26.18 
 
 
350 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  35.74 
 
 
345 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  29.39 
 
 
337 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.24 
 
 
341 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  34.48 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.14 
 
 
337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  38.05 
 
 
340 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  34.87 
 
 
327 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  34.84 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  36.18 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  32.81 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  32.27 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  30.42 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>