More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1142 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 362 aa  707    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  96.95 
 
 		 362 aa  627  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  50.63 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  51.47 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  50.66 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  52.08 
 
 		 340 aa  281  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  48.57 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  48.57 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  38.89 
 
 		 331 aa  169  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  38.41 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  37.74 
 
 		 353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.12 
 
 		 363 aa  155  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  32.58 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  36.04 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  36.03 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  29.96 
 
 		 335 aa  153  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  32.98 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  32.97 
 
 		 380 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  32.13 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  32.96 
 
 		 336 aa  143  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  30.42 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  28.95 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  30.91 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  29.29 
 
 		 315 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  29.53 
 
 		 351 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  25.99 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  27.89 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  38.15 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.49 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.07 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  31.32 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  30.22 
 
 		 338 aa  133  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  34.63 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  26.23 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  30.23 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  27.01 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.92 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  35.32 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  32.92 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  26.28 
 
 		 316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  34.17 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  37.65 
 
 		 350 aa  126  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  33.23 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  30.69 
 
 		 323 aa  126  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  28.91 
 
 		 336 aa  126  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  37.92 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  30.8 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  35.29 
 
 		 310 aa  123  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  27.82 
 
 		 330 aa  123  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  30.26 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.5 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  27.51 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.97 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  30.32 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.43 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  31.38 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  33.22 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  24.93 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  29.18 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  29.9 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  27.59 
 
 		 351 aa  116  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  33.2 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  28.57 
 
 		 371 aa  115  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  33.61 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  32.53 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  35.98 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  31.93 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2402  ApbE family lipoprotein  29.37 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  26.28 
 
 		 344 aa  113  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  31.51 
 
 		 349 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  33.87 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  28.39 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  23.93 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  32.74 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  32.18 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  35.04 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  29.84 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  25.41 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.32 
 
 		 313 aa  110  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  26.98 
 
 		 353 aa  109  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  34.93 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  30.26 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  28.24 
 
 		 325 aa  109  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  35.25 
 
 		 306 aa  109  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  30.06 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  30.94 
 
 		 336 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  35.27 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  30.06 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.35 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  30.06 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  34.78 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  32.03 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  31.1 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  25.96 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  30.43 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  27.63 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  32.07 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  27.67 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  28.18 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>