More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2380 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 368 aa  702    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  96.2 
 
 		 365 aa  636    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  96.18 
 
 		 331 aa  571  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  67.53 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  45.82 
 
 		 386 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  39.02 
 
 		 369 aa  170  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  32.93 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  32.93 
 
 		 346 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.54 
 
 		 363 aa  166  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.44 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  39.62 
 
 		 336 aa  159  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  32.09 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.42 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  37.77 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  36.5 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  34.53 
 
 		 336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  31.02 
 
 		 336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  31.72 
 
 		 328 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  40 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  40 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  37.43 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  30.43 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  36.61 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  40 
 
 		 352 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  34.7 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  28.49 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  35.66 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  37.67 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  28.28 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  35.53 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 366 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  37.92 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  27.21 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  28.62 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  32.38 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  29.12 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  36.09 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  30.4 
 
 		 317 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 		 352 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  34.82 
 
 		 331 aa  135  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  33.23 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.27 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  33.88 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  33.55 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  34.49 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  26.47 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  34.8 
 
 		 332 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  28.43 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  33.22 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  26.77 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  42.49 
 
 		 291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.33 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  33.56 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.79 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  33.56 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  30.92 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  35.16 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  35.21 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.72 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  33.77 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.6 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  33.78 
 
 		 342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  35.97 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  33.1 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  30.18 
 
 		 323 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  26.99 
 
 		 316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  34.08 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  29.97 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.69 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  34.53 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  35.87 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  30.39 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  34.69 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  29.9 
 
 		 380 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  33.88 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  33.81 
 
 		 343 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  33.65 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  35.87 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  36.49 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  30.61 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.39 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  21.73 
 
 		 381 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  35.05 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  25.58 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  36.07 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  33.01 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  34.97 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.23 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  33.09 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  34.64 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  32.71 
 
 		 350 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  31.49 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  30.65 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  31.06 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.27 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  30.43 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  30.2 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.66 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  33.8 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>