More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2402 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2402  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 350 aa  696    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  48.66 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  44.63 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  35.11 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3926  ApbE family lipoprotein  41.06 
 
 		 366 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3188  ApbE family protein  40.73 
 
 		 524 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  37.7 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  37.18 
 
 		 349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  33.23 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  34.32 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3187  positive regulator of sigma E, RseC/MucC  39.61 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.981913 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0511  ApbE family lipoprotein  29.97 
 
 		 360 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  33.05 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  32.68 
 
 		 370 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  33.14 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  32.92 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  34.6 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  28.49 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  32.92 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  29.22 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  32.69 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  25.24 
 
 		 330 aa  125  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  31.67 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  23.15 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  24.19 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.75 
 
 		 341 aa  122  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  29.79 
 
 		 349 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  30.77 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  29.19 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  27.64 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  28.78 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  29.52 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  26.96 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  26.8 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  28.62 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  31.8 
 
 		 305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  29.1 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  32.44 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  28.87 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  33.56 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  33.03 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.85 
 
 		 343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  33.56 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  25.08 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  29.14 
 
 		 380 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  26.56 
 
 		 353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  36.32 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  26.14 
 
 		 374 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  26.38 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  26.38 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  26.38 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  26.38 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.8 
 
 		 347 aa  112  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.87 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  26.14 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  29.47 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  31.05 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  31.77 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  26.14 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  27.61 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.14 
 
 		 350 aa  109  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  35.38 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  26.99 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  30.77 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.8 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  25.07 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.2 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  31.05 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  27.24 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  28.66 
 
 		 355 aa  106  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  33.76 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  30.9 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  28.48 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  26.47 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  25 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  31.16 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  25.39 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  30.7 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  30.07 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  26.85 
 
 		 370 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  29.21 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  26.5 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  27.93 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  30.51 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.98 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  33.33 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  29.74 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.03 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.24 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  25.95 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  31.36 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  30.73 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  25.95 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  27.8 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  25.95 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0984  ApbE family lipoprotein  32.54 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174547 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  29.82 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  27.71 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  31.42 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  32.58 
 
 		 365 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>