More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3099 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 320 aa  634    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  75.77 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  61.17 
 
 		 315 aa  346  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  59.59 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  50.85 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  49.67 
 
 		 329 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0899  ApbE family protein  46.67 
 
 		 365 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.624097  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  48.62 
 
 		 325 aa  252  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  48.28 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  50.68 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  50.5 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3291  ApbE family lipoprotein  49.18 
 
 		 330 aa  242  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238915  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  47.99 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  42.09 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  40.67 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0494  ApbE family protein  56.54 
 
 		 394 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1982  ApbE family protein  56.54 
 
 		 394 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.63389  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  39.93 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0565  ApbE family protein  56.02 
 
 		 404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.53612  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1630  ApbE family protein  56.02 
 
 		 404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0780  ApbE family protein  56.02 
 
 		 404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.725216  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0677  ApbE family protein  56.02 
 
 		 404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385018  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  40.88 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  41.38 
 
 		 362 aa  182  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  39.78 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2079  ApbE family protein  55.5 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  38.41 
 
 		 342 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  38.41 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.84 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  37.98 
 
 		 337 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.13 
 
 		 349 aa  175  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  35.07 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  38.73 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  40.56 
 
 		 800 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  35.84 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  38.18 
 
 		 338 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  40.28 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  38.75 
 
 		 331 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  36.47 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0984  ApbE family lipoprotein  42.42 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  36.3 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  38.44 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  35.4 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  35.51 
 
 		 326 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  36.67 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.33 
 
 		 349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  40.68 
 
 		 348 aa  162  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.3 
 
 		 361 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  35.27 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  35.19 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  34.81 
 
 		 374 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.02 
 
 		 350 aa  159  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  36.86 
 
 		 348 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  36.86 
 
 		 348 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  36.86 
 
 		 348 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  36.86 
 
 		 348 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  35.31 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  34.94 
 
 		 374 aa  159  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.42 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.8 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  33.56 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  33.57 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  40.35 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  34.72 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  33.56 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  31.89 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  31.85 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  35.27 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.63 
 
 		 334 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  36.63 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  32.75 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  36.91 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.97 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  34.97 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  34.97 
 
 		 345 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.8 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.8 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.67 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  27.8 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  27.8 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  27.8 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.8 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.8 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.8 
 
 		 351 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  33.78 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.01 
 
 		 348 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.46 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  31.56 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.78 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  31.97 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0427  ApbE family lipoprotein  38.62 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127952  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.66 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  35.71 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.62 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  34.2 
 
 		 349 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.28 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  33.22 
 
 		 347 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.02 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.62 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.28 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>