More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2093 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
333 aa  672    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.97 
 
 
363 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  33.23 
 
 
353 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  29.94 
 
 
360 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  31.15 
 
 
371 aa  156  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  31.6 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  35.15 
 
 
342 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  35.29 
 
 
381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  26.44 
 
 
348 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  31.09 
 
 
379 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  31.88 
 
 
345 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  32.46 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  32.02 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.57 
 
 
349 aa  139  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.88 
 
 
348 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  33.9 
 
 
343 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.88 
 
 
348 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.04 
 
 
353 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  32.98 
 
 
350 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  29.34 
 
 
386 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  28.48 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  31.82 
 
 
338 aa  136  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  29.76 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.57 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  29.7 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  31.71 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  30.22 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  32.05 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.99 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.92 
 
 
343 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 
349 aa  133  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  30.39 
 
 
349 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.01 
 
 
343 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  30.85 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  28.9 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  28.91 
 
 
374 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  30.86 
 
 
341 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  28.91 
 
 
374 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  28.06 
 
 
370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  28.91 
 
 
374 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.25 
 
 
343 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.57 
 
 
351 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 
339 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  32.63 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.92 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.26 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  28.92 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  28.92 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  28.92 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  26.98 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.92 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  27.73 
 
 
347 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  29.79 
 
 
348 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.92 
 
 
351 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  28.97 
 
 
359 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.97 
 
 
331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.57 
 
 
351 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.69 
 
 
361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  29.2 
 
 
346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  27.13 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.57 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.81 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  28.97 
 
 
345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  28.35 
 
 
351 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  28.4 
 
 
348 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  28.4 
 
 
348 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  28.4 
 
 
348 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  28.4 
 
 
348 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  30.04 
 
 
323 aa  125  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  30.62 
 
 
366 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  29.18 
 
 
331 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.88 
 
 
367 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.73 
 
 
337 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  32.65 
 
 
338 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  27.67 
 
 
338 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  27.76 
 
 
337 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  29.37 
 
 
343 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  30.77 
 
 
323 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.04 
 
 
336 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  27.67 
 
 
379 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.01 
 
 
350 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  27.87 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.66 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  30.52 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.1 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.58 
 
 
337 aa  120  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  30 
 
 
338 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  25.54 
 
 
321 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.22 
 
 
349 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  25.73 
 
 
380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.66 
 
 
350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  24.6 
 
 
338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  28.88 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.66 
 
 
350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.66 
 
 
350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.7 
 
 
344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.88 
 
 
337 aa  119  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.34 
 
 
347 aa  119  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  29.15 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>