More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0009 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  100 
 
 		 346 aa  709    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  58.51 
 
 		 344 aa  368  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  53.23 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  47.45 
 
 		 352 aa  297  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  49.04 
 
 		 370 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  48.17 
 
 		 352 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  49.04 
 
 		 352 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  50.9 
 
 		 291 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  40.32 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  37.54 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3187  positive regulator of sigma E, RseC/MucC  40.57 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.981913 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  36.92 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3926  ApbE family lipoprotein  40.66 
 
 		 366 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  36.79 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3188  ApbE family protein  40.98 
 
 		 524 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2402  ApbE family lipoprotein  33.87 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0511  ApbE family lipoprotein  28.36 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  33.23 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  33.22 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  29.28 
 
 		 380 aa  146  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  28.65 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.09 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  30.86 
 
 		 353 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  32.18 
 
 		 355 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  31.23 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  31.87 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  31.79 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  33.23 
 
 		 351 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  31.23 
 
 		 349 aa  133  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  32.82 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  30.63 
 
 		 348 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  28.74 
 
 		 371 aa  131  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  34.96 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  30.03 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  26.63 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.57 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  31.17 
 
 		 369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  27.63 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  33.06 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  33.06 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  33.06 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  38.42 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  33.06 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  32.76 
 
 		 343 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.09 
 
 		 343 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  28.09 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  31.33 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.97 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  29.85 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  30.22 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  34.51 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  29.85 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  29.39 
 
 		 350 aa  125  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  28.9 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.75 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  28.07 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.7 
 
 		 361 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  27 
 
 		 338 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  34.96 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.07 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  28.36 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  26.8 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  30.66 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  28.36 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  26.05 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  26.64 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  29.13 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  33.6 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  28.18 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  30.53 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  31.96 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  28.72 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.1 
 
 		 347 aa  119  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  28.07 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.02 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.71 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  27.68 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.19 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  29.88 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  33.33 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  24.14 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  34.21 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  24.53 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  29.73 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  26.21 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  28.18 
 
 		 337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  33.03 
 
 		 331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.45 
 
 		 313 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  27.59 
 
 		 350 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  25.23 
 
 		 338 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  34.87 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.55 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  32.71 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.12 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  34.2 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  32.81 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  31.7 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  25.33 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  34.36 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  34.36 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>