More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0542 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 313 aa  621  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  54.46 
 
 		 316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  53.95 
 
 		 305 aa  289  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  45.28 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  45.76 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0696  ApbE family lipoprotein  35.47 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2080  ApbE family lipoprotein  35.14 
 
 		 370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.744114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  39.73 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  36.9 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  35.94 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  29.29 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  39.71 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.55 
 
 		 363 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  32.47 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  28.72 
 
 		 339 aa  115  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  26.14 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1622  ApbE family lipoprotein  38.61 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.496862  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  30.33 
 
 		 351 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2585  ApbE-like lipoprotein  38.16 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.501359  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  27.74 
 
 		 345 aa  112  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.2 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.8 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  31.39 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  32.23 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  32.71 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  32.23 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  34.5 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  32.23 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  31.39 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  32.23 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  25.82 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.81 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  31.11 
 
 		 275 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  31.02 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.05 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  29.73 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  28.97 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  31.85 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  29.49 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  29.6 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  28.71 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  29.67 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  27.3 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  28.71 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  29.17 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.52 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  30.89 
 
 		 365 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  30.89 
 
 		 368 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  32.13 
 
 		 369 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  33.33 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  27.92 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  33.46 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  29.13 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  26 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  27.15 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  26.43 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.47 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25 
 
 		 343 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  30.91 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.3 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  29.79 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  34.73 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  29.32 
 
 		 353 aa  96.3  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  27.87 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  29.03 
 
 		 312 aa  96.3  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  26.89 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  29.45 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  29.14 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  29.47 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.49 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  27.49 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  29.67 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  30.46 
 
 		 344 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  32.33 
 
 		 337 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  26.6 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  23.78 
 
 		 342 aa  92.4  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30 
 
 		 337 aa  91.7  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  25.76 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  30.77 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  34.57 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.95 
 
 		 343 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  28.08 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  26.71 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  31.35 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  30.2 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.62 
 
 		 337 aa  90.1  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3004  ApbE-like lipoprotein  37.6 
 
 		 274 aa  89.4  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  27.36 
 
 		 336 aa  89  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  25.5 
 
 		 380 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  28.05 
 
 		 342 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  25.93 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  34.3 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  28.97 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  31.91 
 
 		 340 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  25.09 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  31.27 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  28.38 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  27.05 
 
 		 370 aa  87  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  23.77 
 
 		 366 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.74 
 
 		 341 aa  86.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>