254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0696 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0696  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 360 aa  748    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2080  ApbE family lipoprotein  87.43 
 
 		 370 aa  655    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.744114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  37.2 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  35.47 
 
 		 313 aa  159  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  35.33 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  33.82 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  30.96 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  30.17 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  23 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  24.79 
 
 		 343 aa  97.1  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  29.41 
 
 		 313 aa  96.3  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  25.65 
 
 		 349 aa  92.4  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  30.11 
 
 		 323 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  25.67 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  27.83 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  25.32 
 
 		 349 aa  90.5  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  26.51 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  28.67 
 
 		 298 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  25.41 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  26.02 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  26.02 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  26.02 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  26.02 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  24.12 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  24.91 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  26.38 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  26.38 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  26.38 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  29.32 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  27.04 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  28.81 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  22.3 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  26.55 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  26.89 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  28.42 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.58 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  23.18 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  27.88 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  26.23 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  22.46 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  28.42 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  28.73 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  23.95 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  27.49 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  23.64 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  25.69 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  23.43 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  24.58 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  28.42 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  25.15 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  25.16 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  27.02 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  24.56 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  26.3 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  25.67 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  26.47 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  25.69 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  24.84 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  23.33 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.01 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  22.67 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  26.7 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  24.17 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  21.55 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  25.25 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  26.94 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  25.21 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  25.71 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  26.79 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.09 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  28.52 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  25.58 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  26.19 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  25.73 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  23.15 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.24 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  26.15 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  26.77 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  25.45 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  27.07 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  25.77 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  22.48 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  26.21 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.32 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.6 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  24.92 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  21.77 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  25.85 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  23.96 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  25.17 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  26.65 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  22.03 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  24.12 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  26.21 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  25.09 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  26.52 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.63 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  24.12 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>