More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0609 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 316 aa  628  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  69.84 
 
 		 305 aa  431  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  55.7 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  46.75 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  46.05 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2080  ApbE family lipoprotein  34.69 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.744114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0696  ApbE family lipoprotein  33.82 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  39.72 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  41.43 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  37.59 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  32.44 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  31.46 
 
 		 353 aa  132  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  32.38 
 
 		 336 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.58 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  28.75 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  29.84 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.26 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  37.42 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.93 
 
 		 363 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  31.33 
 
 		 371 aa  121  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  28.21 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  27.24 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  28.05 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  36.73 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  27.09 
 
 		 348 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.8 
 
 		 361 aa  119  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30.66 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  35.42 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  24.36 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  28.38 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  26.89 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  35.16 
 
 		 345 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  32.41 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  35.27 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  28.24 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  33.45 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  34.18 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  33.76 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  33.76 
 
 		 301 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  33.76 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  31.53 
 
 		 344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  34.91 
 
 		 365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  32.65 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  29.53 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  29.17 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  28.62 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  23.73 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  35.2 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  31.43 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  26.12 
 
 		 316 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  32.73 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  31.53 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  27.9 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2585  ApbE-like lipoprotein  39.03 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.501359  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  28.9 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  31.32 
 
 		 379 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.16 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.46 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  29.96 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  32.01 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.28 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  27.44 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  33.33 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  27.11 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  32.33 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  35.56 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  24.52 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  30.04 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  37.67 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  27.8 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  31.65 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  26.28 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  28.16 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  28.16 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  31.94 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.95 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  28.16 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  28.16 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  34.75 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  30.12 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  36.11 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  29.39 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.06 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  29.59 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  24.24 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  31.14 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  31.14 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  33.1 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  28.14 
 
 		 352 aa  99.4  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  30.24 
 
 		 336 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  25.08 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  26.71 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  30.48 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  31.08 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  32.23 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  26.8 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.38 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>