295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1182 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 298 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2585  ApbE-like lipoprotein  51.9 
 
 		 350 aa  215  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.501359  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1622  ApbE family lipoprotein  53.31 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.496862  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  46.83 
 
 		 313 aa  175  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  45.67 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  39.32 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  37.14 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  39.17 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  40.5 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  39.84 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  30.6 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  34.11 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  28.63 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  30.08 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  30.08 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  29.73 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  30.08 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  29.69 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  27.21 
 
 		 345 aa  99  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  29.23 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  27.18 
 
 		 339 aa  98.2  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  32.72 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  25.89 
 
 		 343 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  27.84 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  32.28 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  28.94 
 
 		 366 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  27.95 
 
 		 349 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  30.86 
 
 		 349 aa  92.4  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  29.55 
 
 		 330 aa  92.4  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  30.48 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  32.06 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 		 379 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  26.54 
 
 		 371 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  31.73 
 
 		 336 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.67 
 
 		 341 aa  89.4  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  27.97 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  28.15 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2080  ApbE family lipoprotein  27.97 
 
 		 370 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.744114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  28.15 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  28.15 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  29.7 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  28.15 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  28.35 
 
 		 347 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  32.27 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0696  ApbE family lipoprotein  28.67 
 
 		 360 aa  87  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  28.63 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  25.1 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  28.63 
 
 		 374 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.44 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  32.39 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  31.16 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  26.92 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  28.2 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  28.91 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  25.78 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  26.01 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  27.65 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  28.24 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.05 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  28.78 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2154  ApbE family lipoprotein  35.76 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  34.13 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.86 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  26.32 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  34.96 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.76 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  27.73 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  27.14 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  29.9 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  30.51 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  30.37 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  29.84 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  26.26 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  27.89 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  26.77 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  31.56 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  26.97 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  25.45 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  24.73 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  30.17 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  26.44 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  30.74 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  31.02 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  30.1 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  29.27 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.67 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  28.1 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1291  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.710022  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  26.96 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  30.11 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  25.77 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.42 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  24.92 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  30.21 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  33.47 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>