287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3829 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 313 aa  596  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  46.83 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  45.55 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2585  ApbE-like lipoprotein  43.77 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.501359  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  39.64 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  37.1 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  39.34 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  32.89 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1622  ApbE family lipoprotein  43.71 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.496862  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  33.56 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  35.8 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  31.9 
 
 		 349 aa  105  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  31.54 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0696  ApbE family lipoprotein  29.41 
 
 		 360 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  37.17 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  34.32 
 
 		 335 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  29.23 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  34.59 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  37.84 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2080  ApbE family lipoprotein  29.45 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.744114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  37.84 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  37.84 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  28.84 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  37.16 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  29.04 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  26.91 
 
 		 339 aa  92.4  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  33.01 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  28.46 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  28.22 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  34.2 
 
 		 341 aa  89.7  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0984  ApbE family lipoprotein  34.94 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174547 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  30.96 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  35.51 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  28.73 
 
 		 275 aa  86.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  29.79 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  26.69 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  33.6 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  28.41 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.26 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  35.1 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  27.02 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  33.33 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  26.85 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  27.72 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  26.85 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  26.85 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  26.85 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.87 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  25.84 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  29.32 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  29.1 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  26.17 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  25.87 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  25.84 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  29.57 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  29.22 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  32.63 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  26.17 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  30.24 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  32.09 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  29.3 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  34.82 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  26.42 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  28.77 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  34.92 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  31.37 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  28.69 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  34.15 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  28.21 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  27.59 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  25.52 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.49 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  27.07 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  30.25 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  33.97 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  29.14 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  27.7 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  31.91 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  27.51 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1291  ApbE family lipoprotein  31.91 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.710022  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  25.66 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.05 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  32.07 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.45 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.34 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  23.72 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  31.7 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  30.58 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  30.8 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  28.92 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0051  ApbE family lipoprotein  30.69 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.252526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  25.08 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.79 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  27.5 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  33.83 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.26 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.48 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.57 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.21 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>