More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2601 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
304 aa  605  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  29.75 
 
 
339 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  31.45 
 
 
336 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  32.62 
 
 
325 aa  105  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  36.76 
 
 
316 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  32.62 
 
 
325 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.03 
 
 
350 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.15 
 
 
363 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  34.1 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  30.11 
 
 
349 aa  97.4  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  30.11 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  30.83 
 
 
355 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  30.93 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  31.77 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  34.88 
 
 
335 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  34.17 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2154  ApbE family lipoprotein  37.93 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  31.7 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  28 
 
 
366 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  32.97 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  35.59 
 
 
309 aa  89.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  25.35 
 
 
360 aa  89  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  34.96 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  28.73 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5381  ApbE family lipoprotein  34.85 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  27.53 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  23.27 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1846  ApbE family lipoprotein  34.85 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000243371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  27.61 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  32.52 
 
 
338 aa  87  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  31.25 
 
 
308 aa  87  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  27.92 
 
 
349 aa  86.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  28.74 
 
 
315 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0708  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  34.87 
 
 
287 aa  85.9  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314159  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  27.05 
 
 
309 aa  85.9  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  27.52 
 
 
353 aa  85.9  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  31.71 
 
 
299 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  28.25 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  26.17 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  28.37 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  38.69 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  24.37 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  32.34 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.05 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  31.79 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2627  hypothetical protein  32.68 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3580  ApbE family protein, putative  30.14 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  24.6 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  31.84 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3383  ApbE family lipoprotein  31.02 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  32.03 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.56 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  28.79 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  35.51 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  30.66 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.8 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  32.41 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0906  ApbE family protein, putative  30.14 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00687299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  29.54 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  29.1 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3457  ApbE family protein, putative  30.14 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.78 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0611  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  44.7 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  33.73 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  30.65 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  25.76 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  25.78 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  25.98 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  30.17 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  35.18 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  26.17 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0511  ApbE family lipoprotein  27.99 
 
 
360 aa  77  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.71 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  27.56 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.31 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  26.01 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1291  ApbE family lipoprotein  33.91 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.710022  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.42 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0957  ApbE family protein, putative  30.99 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.76647  normal  0.566735 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3291  ApbE family lipoprotein  29.32 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238915  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2657  ApbE family protein, putative  28.05 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00549568  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  24.26 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  30.08 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0921  ApbE family protein, putative  30.99 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0949043  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  30.11 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1800  ApbE family lipoprotein  28.82 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000665627  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  29.82 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  31.58 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  28.06 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  23.47 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1090  ApbE family protein, putative  26.78 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  25.36 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  26.01 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1565  ApbE family lipoprotein  29.8 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0922  ApbE family protein, putative  30.99 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767638  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  28.29 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3433  ApbE family lipoprotein  27.81 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  23.78 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1180  ApbE-like lipoprotein  34.23 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.91 
 
 
341 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>