231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1180 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1180  ApbE-like lipoprotein  100 
 
 		 286 aa  570  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1846  ApbE family lipoprotein  55.05 
 
 		 282 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000243371 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5381  ApbE family lipoprotein  55.05 
 
 		 282 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0611  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  43.86 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1565  ApbE family lipoprotein  37.79 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3433  ApbE family lipoprotein  38.75 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0708  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  39.79 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314159  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  40.6 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1800  ApbE family lipoprotein  37.77 
 
 		 279 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000665627  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0957  ApbE family protein, putative  34.72 
 
 		 282 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.76647  normal  0.566735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0921  ApbE family protein, putative  34.34 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0949043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3383  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0922  ApbE family protein, putative  33.96 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767638  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3457  ApbE family protein, putative  33.95 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0906  ApbE family protein, putative  33.95 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00687299  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3580  ApbE family protein, putative  32.08 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1886  ApbE family lipoprotein  36.23 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00789462  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1557  ApbE family lipoprotein  35.85 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1090  ApbE family protein, putative  32.33 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2657  ApbE family protein, putative  34.69 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00549568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0416  ApbE-like lipoprotein  31.65 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00253803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  36.74 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  26.55 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  31.05 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  34.26 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  29.92 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  34.26 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  28.47 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  33.1 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  29.8 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  23.93 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  28.8 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  27.34 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  33.19 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  29.88 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  33.1 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  29.25 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.07 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  32.74 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  24.91 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  22.81 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  34.23 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  28.88 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  30.23 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  25.52 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  31.23 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  27.21 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  29.07 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  26.49 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  25.53 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  32.28 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  27.84 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  30 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  22.5 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.33 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  29.08 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  23.92 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  23.99 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  26.79 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  26.24 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  33.19 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  25.09 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  28.52 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.65 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.52 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  30.67 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  30.99 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.19 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  29.84 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  25.2 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  24.42 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  23.37 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  32.2 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  28.21 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  30.71 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  28.74 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  33.16 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.36 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  23.73 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  25.53 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.38 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  25.85 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  30.65 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  30.99 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  27.55 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  30.92 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  28.91 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  24.65 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.17 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  24.81 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  28.02 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  30.63 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  23.34 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>