271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1565 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1565  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 277 aa  570  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5381  ApbE family lipoprotein  37.1 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1846  ApbE family lipoprotein  37.1 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000243371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3433  ApbE family lipoprotein  40.22 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0611  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  39.64 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1180  ApbE-like lipoprotein  37.79 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  34.29 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0708  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  34.07 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314159  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3580  ApbE family protein, putative  33.33 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0906  ApbE family protein, putative  34.07 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00687299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3457  ApbE family protein, putative  34.07 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1557  ApbE family lipoprotein  34.31 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1800  ApbE family lipoprotein  36.06 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000665627  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1886  ApbE family lipoprotein  33.58 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00789462  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3383  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0921  ApbE family protein, putative  32.57 
 
 		 282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0949043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0957  ApbE family protein, putative  32.18 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.76647  normal  0.566735 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0416  ApbE-like lipoprotein  33.21 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00253803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0922  ApbE family protein, putative  31.8 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767638  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1090  ApbE family protein, putative  31.03 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2657  ApbE family protein, putative  33.98 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00549568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  31.46 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  32.38 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.75 
 
 		 336 aa  95.9  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  30.61 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  30.43 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  34.04 
 
 		 349 aa  89  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  31.03 
 
 		 351 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  24.91 
 
 		 362 aa  86.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  26.62 
 
 		 339 aa  85.5  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  26.98 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0909  ApbE family lipoprotein  28.62 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.503634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  30.38 
 
 		 343 aa  82  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  29.49 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  27.31 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  28.15 
 
 		 335 aa  79  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  29.05 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.25 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  27.31 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  25.46 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  27.65 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  28.27 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  27.11 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  25.97 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.13 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  28.14 
 
 		 349 aa  75.5  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  27.8 
 
 		 337 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 349 aa  75.5  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  26.21 
 
 		 316 aa  75.5  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.44 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  26.36 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.52 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.41 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  29.57 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  28.99 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  24.9 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  27.44 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1188  ApbE-like lipoprotein  23.71 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  25.21 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  30.4 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  27.71 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  27.5 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.5 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  27.5 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  28.57 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.69 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  27.24 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 380 aa  68.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  24.65 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  26.25 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  27 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  26.25 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  28.44 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  23.65 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  24.28 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  26.25 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  25.52 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  28.29 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  26.25 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  26.07 
 
 		 312 aa  67  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  27.87 
 
 		 379 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  26.39 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  25.13 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  26.39 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  26.1 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  26.14 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  27.57 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.92 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  28.88 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  27.41 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  27.89 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  26.67 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.19 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.73 
 
 		 334 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  27.35 
 
 		 352 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  26.86 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  27.08 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  27.56 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  29.41 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2856  ApbE family lipoprotein  23.79 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>