145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3457 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0906  ApbE family protein, putative  100 
 
 		 281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00687299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3457  ApbE family protein, putative  100 
 
 		 281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3383  ApbE family lipoprotein  95.02 
 
 		 281 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3580  ApbE family protein, putative  95.02 
 
 		 281 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0922  ApbE family protein, putative  79.29 
 
 		 282 aa  447  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767638  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0957  ApbE family protein, putative  79.64 
 
 		 282 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.76647  normal  0.566735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0921  ApbE family protein, putative  78.93 
 
 		 282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0949043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1090  ApbE family protein, putative  76.98 
 
 		 279 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2657  ApbE family protein, putative  43.93 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00549568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0416  ApbE-like lipoprotein  37.21 
 
 		 277 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00253803  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1800  ApbE family lipoprotein  37.06 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000665627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0708  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  37.22 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314159  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1180  ApbE-like lipoprotein  33.95 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5381  ApbE family lipoprotein  35.96 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1846  ApbE family lipoprotein  35.96 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000243371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1565  ApbE family lipoprotein  32.96 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0611  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  39.13 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3433  ApbE family lipoprotein  36.61 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1886  ApbE family lipoprotein  34.71 
 
 		 259 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00789462  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1557  ApbE family lipoprotein  35.32 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  34.72 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  30.14 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  23.11 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  26.89 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  28.8 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  28.96 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  32.61 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  24.82 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  26.57 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  24.63 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  29.57 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  25.51 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  29.66 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  29.73 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.12 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.52 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  25.77 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  29.66 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  33.13 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  25.3 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  28.47 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  27.14 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  29.6 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.52 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1758  ApbE family lipoprotein  33.11 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  31.54 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  29.86 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  27.1 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  26.19 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  28.23 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  29.19 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4341  ApbE family lipoprotein  29.08 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  28.97 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1000  ApbE family lipoprotein  30.57 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.508503  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  26.26 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  28.46 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  31.1 
 
 		 345 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  28.22 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  35.46 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  26.36 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  28.75 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  32.88 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  26.85 
 
 		 350 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  26.84 
 
 		 349 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 344 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  26.84 
 
 		 349 aa  53.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  32.41 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  28.57 
 
 		 342 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  28.26 
 
 		 321 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  28.35 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  25.53 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  30.56 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  24.82 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  31.9 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  30.56 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  28.12 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.65 
 
 		 337 aa  50.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.38 
 
 		 349 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.39 
 
 		 343 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  28.12 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  26.61 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  28.3 
 
 		 336 aa  49.7  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  32.08 
 
 		 386 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  24.24 
 
 		 315 aa  48.9  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.11 
 
 		 344 aa  49.3  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2485  ApbE family lipoprotein  28.09 
 
 		 304 aa  48.9  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  31.47 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  27.41 
 
 		 362 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  33.1 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  26.47 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.85 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  25.69 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  29.17 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  30.66 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  29.22 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 360 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  26.54 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.35 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3326  hypothetical protein  30.71 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128315 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  35.64 
 
 		 347 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>