More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1835 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 310 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  37.55 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  38.43 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  25.55 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1565  ApbE family lipoprotein  31.28 
 
 		 277 aa  109  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  32.12 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  34.85 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  34.2 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.46 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  36.78 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3433  ApbE family lipoprotein  33.91 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  36.54 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  34.97 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0708  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  38.37 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314159  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  31.97 
 
 		 345 aa  102  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  37.84 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  33.71 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  28.07 
 
 		 339 aa  99.8  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  29.55 
 
 		 350 aa  99.8  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.98 
 
 		 343 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  30.97 
 
 		 370 aa  98.2  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  29.85 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.21 
 
 		 350 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  28.73 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  36.93 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  33.33 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  34.01 
 
 		 347 aa  95.9  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  35.96 
 
 		 325 aa  95.9  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  35.96 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  34.08 
 
 		 362 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1180  ApbE-like lipoprotein  37.02 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  33.98 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5381  ApbE family lipoprotein  35.57 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  33.05 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1846  ApbE family lipoprotein  35.57 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000243371 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  28.57 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  31.18 
 
 		 317 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.04 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  36.86 
 
 		 341 aa  93.2  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  33.47 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  37.08 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 349 aa  92.4  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  27.37 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  33.21 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  30.27 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  31.73 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  29.33 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  35.83 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  30.81 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  31.33 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.14 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  37.39 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  26.62 
 
 		 337 aa  90.1  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  37.24 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3291  ApbE family lipoprotein  34.47 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238915  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  30.08 
 
 		 341 aa  89.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  30.88 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  36.02 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  43.51 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  38.75 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  28.84 
 
 		 380 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  27.9 
 
 		 366 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  25.56 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  28.24 
 
 		 352 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.57 
 
 		 363 aa  86.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  30.42 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  36.4 
 
 		 340 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  32.58 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  26.47 
 
 		 342 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  35.95 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  28.95 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.47 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  33.02 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1758  ApbE family lipoprotein  29.75 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1800  ApbE family lipoprotein  35.05 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000665627  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  30.18 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  33.61 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  28.04 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  30.11 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  25.08 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  33.09 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  32.67 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  33.61 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  28.41 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  28.41 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  28.41 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  28.41 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.96 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  29.26 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  29.83 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  29.1 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.82 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  29.04 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.12 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.04 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  26.4 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.03 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  34.07 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  31 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>