More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3291 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3291  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 330 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238915  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  64.65 
 
 		 325 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  64.33 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  50.16 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  50.46 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  52.22 
 
 		 327 aa  279  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  50.94 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  51.9 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0899  ApbE family protein  47.8 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.624097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  52.17 
 
 		 305 aa  269  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  51.34 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  49.67 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  48.7 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1982  ApbE family protein  43.47 
 
 		 394 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.63389  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0494  ApbE family protein  43.47 
 
 		 394 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  42.33 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2079  ApbE family protein  56 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0780  ApbE family protein  56 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.725216  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1630  ApbE family protein  56 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0677  ApbE family protein  56 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0565  ApbE family protein  56 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.53612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  37.76 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  40.52 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  44.3 
 
 		 345 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  40.07 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  36.74 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  38.51 
 
 		 343 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.18 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  38.67 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  35.92 
 
 		 338 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  35.96 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  35.92 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  40.96 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  34.75 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.71 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  36.45 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  40.75 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  37.75 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  34.84 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  36.18 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  34.06 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  33.55 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  33.55 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  37.63 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  41.33 
 
 		 800 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  33.55 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.55 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.21 
 
 		 367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.55 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  37.2 
 
 		 338 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  37.63 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.55 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  38.23 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  34.11 
 
 		 344 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.67 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  40.96 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  36.77 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  36.49 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  35.35 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.23 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.84 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  39.73 
 
 		 326 aa  176  6e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.96 
 
 		 350 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  34.02 
 
 		 379 aa  175  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.96 
 
 		 350 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.96 
 
 		 350 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  35.81 
 
 		 370 aa  175  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  37 
 
 		 347 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.65 
 
 		 350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  35.93 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.02 
 
 		 334 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  34.93 
 
 		 349 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  35.59 
 
 		 374 aa  172  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0984  ApbE family lipoprotein  43.19 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174547 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  40.2 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  35.59 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  36.05 
 
 		 347 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  34.67 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  36.15 
 
 		 348 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  36.15 
 
 		 348 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  36.15 
 
 		 348 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  36.15 
 
 		 348 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  36.45 
 
 		 359 aa  169  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  36.45 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.45 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  33.66 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  39.93 
 
 		 362 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  29.06 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.52 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  38.33 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.9 
 
 		 351 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  34.65 
 
 		 343 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1900  ApbE-like lipoprotein  34.32 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  0.0133899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.31 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  40.6 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.17 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0695  ApbE-like lipoprotein  31.17 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  30.14 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  37.94 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.88 
 
 		 349 aa  155  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>