290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1758 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1758  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 299 aa  619  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  30.25 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 335 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 315 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  30.11 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  29.29 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  29.19 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  27.92 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0909  ApbE family lipoprotein  27.78 
 
 		 293 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.503634  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  27.96 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  31.79 
 
 		 345 aa  105  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  29.66 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.29 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  32.47 
 
 		 386 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  27.66 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  28.17 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  29.21 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  24.73 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  26.91 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.14 
 
 		 363 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.36 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  30.3 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  29.89 
 
 		 358 aa  90.5  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  29.78 
 
 		 371 aa  89  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  27.73 
 
 		 350 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  22.68 
 
 		 348 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  24.73 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  28.06 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  28.11 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  26.23 
 
 		 360 aa  85.5  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  26.03 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  25.42 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  25.71 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  25.96 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3433  ApbE family lipoprotein  27.65 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  29.48 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  26.62 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  25.72 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  26.51 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  26.51 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  23.81 
 
 		 361 aa  79  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  31.31 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  29.19 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  27.68 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  29.19 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  24.81 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  24.49 
 
 		 366 aa  79  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  29.19 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  24.51 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  30.08 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  36.22 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  23.05 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  26.07 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  25.77 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  22.88 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  28.64 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.38 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  26.41 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  26.48 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  28.91 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  21.79 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  24.32 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  25.09 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  26.82 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1971  ApbE family lipoprotein  22.62 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.196908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  28.22 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  25.73 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  28.57 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  24.81 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.01 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  26.64 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0611  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  32.2 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.96 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  26.13 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.34 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  27.23 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2090  ApbE family lipoprotein  22.46 
 
 		 427 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  22.66 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  24.37 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2280  ApbE family lipoprotein  28.45 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.506741 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  24.82 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  26.21 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  27.08 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  26.34 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  25.56 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  24.19 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.1 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  26.43 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  28.23 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  20.57 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.91 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  25.44 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  22.3 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  22.3 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  26.43 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  29.95 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  22.18 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.66 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.66 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>