More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2090 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2090  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 427 aa  887    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2280  ApbE family lipoprotein  59.83 
 
 		 372 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.506741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1971  ApbE family lipoprotein  56.45 
 
 		 392 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.196908 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1418  apbE family protein  54.55 
 
 		 375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  35.91 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  29.62 
 
 		 360 aa  136  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  31.17 
 
 		 345 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  28.1 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  28.69 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  28.99 
 
 		 353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.1 
 
 		 363 aa  127  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  29.37 
 
 		 330 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  27.52 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  31.93 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  29.78 
 
 		 371 aa  122  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  29.69 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 349 aa  120  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  27.63 
 
 		 342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  24.38 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.07 
 
 		 361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  26.51 
 
 		 379 aa  113  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  26.14 
 
 		 379 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.47 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  26.3 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  25 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.28 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  25.75 
 
 		 352 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  23.7 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  25 
 
 		 350 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  30.13 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  28.68 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  26.52 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  22.57 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.52 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  25.65 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  29.22 
 
 		 354 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  25.52 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  25.08 
 
 		 350 aa  107  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  26.78 
 
 		 308 aa  106  7e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  30.2 
 
 		 315 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  28.82 
 
 		 353 aa  106  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.73 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  27.92 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  27.11 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  25.97 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  29.31 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  28.4 
 
 		 320 aa  104  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  28.97 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  23.1 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.59 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  27.2 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.31 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  23.6 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  22.86 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.02 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  23.18 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  27.33 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  28.81 
 
 		 323 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.75 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  26.34 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.33 
 
 		 306 aa  99.8  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  25.78 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  21.18 
 
 		 335 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  24.23 
 
 		 345 aa  98.2  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  24.06 
 
 		 338 aa  96.7  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  26.98 
 
 		 309 aa  96.7  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  25.32 
 
 		 321 aa  96.3  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  27 
 
 		 316 aa  96.3  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  26.72 
 
 		 344 aa  96.3  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  26.37 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  27.01 
 
 		 325 aa  95.9  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  23.68 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.11 
 
 		 349 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  25.93 
 
 		 341 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  24.09 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  26.64 
 
 		 308 aa  94.4  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  23.55 
 
 		 332 aa  94  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  26.35 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  22.14 
 
 		 341 aa  94  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  23.61 
 
 		 348 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 		 343 aa  93.6  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  23.61 
 
 		 348 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  23.61 
 
 		 348 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  23.61 
 
 		 348 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0695  ApbE-like lipoprotein  23.9 
 
 		 337 aa  93.6  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  24.47 
 
 		 345 aa  93.2  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  22.49 
 
 		 321 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  24.29 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  23.81 
 
 		 347 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  22.18 
 
 		 355 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  26.5 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2431  ApbE-like lipoprotein  26.09 
 
 		 382 aa  92  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.12 
 
 		 349 aa  92.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  23.92 
 
 		 359 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  23.92 
 
 		 331 aa  91.3  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  23.92 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  24.38 
 
 		 302 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  26.46 
 
 		 350 aa  90.9  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  24.81 
 
 		 336 aa  90.9  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>