173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0416 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0416  ApbE-like lipoprotein  100 
 
 		 277 aa  573  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00253803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1090  ApbE family protein, putative  39.38 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2657  ApbE family protein, putative  40.48 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00549568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3383  ApbE family lipoprotein  37.6 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0921  ApbE family protein, putative  38.67 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0949043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0906  ApbE family protein, putative  37.21 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00687299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3457  ApbE family protein, putative  37.21 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3580  ApbE family protein, putative  37.6 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0922  ApbE family protein, putative  38.28 
 
 		 282 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767638  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0957  ApbE family protein, putative  37.89 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.76647  normal  0.566735 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1800  ApbE family lipoprotein  40 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000665627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0708  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  35.46 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314159  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1565  ApbE family lipoprotein  32.36 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0611  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  33.33 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1846  ApbE family lipoprotein  31.34 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000243371 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5381  ApbE family lipoprotein  31.34 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1180  ApbE-like lipoprotein  31.65 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1557  ApbE family lipoprotein  31.02 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1886  ApbE family lipoprotein  30.43 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00789462  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  32.33 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3433  ApbE family lipoprotein  32.21 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  25.58 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  26.52 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  25.78 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  26.2 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  23.73 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  27 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  23.95 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  24.19 
 
 		 339 aa  67  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  24.54 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  24.32 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  33.09 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  25.27 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  24.63 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  24.44 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  23.53 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  25.52 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  25.52 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  26.51 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  27.06 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  24.47 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  22.55 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  23.16 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  26.26 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  27.57 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  21.43 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  24.47 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  25.18 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  29.14 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  26.11 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.65 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  24.41 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  23.51 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  24.41 
 
 		 351 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  26.11 
 
 		 331 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  25.91 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  23.76 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  28.26 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  28.48 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  27.19 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.34 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  23.94 
 
 		 347 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  24.41 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  24.41 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  23.27 
 
 		 350 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  27.19 
 
 		 344 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  28.81 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  25.48 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  23.58 
 
 		 355 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  26.21 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  28.97 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  23.6 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  22.99 
 
 		 343 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  22.83 
 
 		 347 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  27.67 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  21.79 
 
 		 360 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0349  thiamine biosynthesis lipoprotein, putative  27.8 
 
 		 339 aa  52.8  0.000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6245  ApbE family lipoprotein  27.12 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  28.76 
 
 		 346 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  26.45 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  24.34 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  25.14 
 
 		 368 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  26.44 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  25.1 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  28.76 
 
 		 346 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  23.62 
 
 		 345 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  23.62 
 
 		 359 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  23.62 
 
 		 331 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  22.61 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  25.1 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  24.73 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  26.54 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  25.14 
 
 		 347 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0973  ApbE family lipoprotein  22.58 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  22.79 
 
 		 345 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  21.62 
 
 		 329 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  23.28 
 
 		 341 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  25.19 
 
 		 342 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>