247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1291 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1291  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 285 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.710022  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2627  hypothetical protein  43.88 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39465  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2154  ApbE family lipoprotein  45.88 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2360  ApbE family lipoprotein  46.07 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000706086 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1526  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  33.44 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0153  thiamine biosynthesis lipoprotein, ApbE family  30.94 
 
 		 349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.191913 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  32.51 
 
 		 351 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  27.99 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  30.48 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.57 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  27.65 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  31.87 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  28.65 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  25.65 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  33.7 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.14 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  29.17 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  32.09 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  24.28 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.64 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  20.65 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  32.03 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  29.05 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  28.46 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  27.38 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  23.75 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  23.73 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  27.35 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.51 
 
 		 347 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  23.17 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.16 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  28.46 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  28.5 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  28.81 
 
 		 340 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  27.92 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  26.36 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  28.69 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  24.1 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  30.52 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  27.92 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  29.05 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  24.68 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  22.92 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  29.05 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  27.54 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  29.05 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  29.05 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  25.94 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  27.03 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.08 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  29.41 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  29.41 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  27.57 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  29.66 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  33.09 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.98 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.29 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  23.57 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  24.71 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  33.59 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  35.51 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0051  ApbE family lipoprotein  34.84 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.252526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  23.77 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  29 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  28.79 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  23.62 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  28.41 
 
 		 347 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  27.17 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.45 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  26.21 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  26.12 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  26.23 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  26.87 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  27.84 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  26.72 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.59 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.97 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  24.57 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  20.68 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  31.21 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  26.14 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.1 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  27.54 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.37 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  26.58 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  29.38 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  33.83 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  34.57 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.94 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  28.16 
 
 		 386 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.52 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2585  ApbE-like lipoprotein  30.04 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.501359  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  19.69 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  23.53 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  32 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1565  ApbE family lipoprotein  24.77 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  26.23 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>