276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2585 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2585  ApbE-like lipoprotein  100 
 
 		 350 aa  663    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.501359  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  51.9 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  42.16 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1622  ApbE family lipoprotein  49.35 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.496862  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  43.77 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  41.48 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  38.52 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  36.78 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  39.03 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  38.49 
 
 		 305 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  34.21 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  34.33 
 
 		 379 aa  95.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  26.69 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  32.54 
 
 		 331 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  23.33 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  30.99 
 
 		 275 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  31.9 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.71 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  29.46 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  27.31 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.51 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  28.35 
 
 		 298 aa  86.3  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  32.82 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  25.28 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  30.12 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  28.75 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  29.53 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.27 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.51 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  28.75 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  26.37 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  29.27 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.08 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.51 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.51 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.51 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.08 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.62 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  25.51 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  26.17 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  26.17 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  29.59 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.08 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.17 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  26.17 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  30.52 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  24.92 
 
 		 336 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  30.37 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.08 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.17 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  32.19 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  28.17 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.69 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.74 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2080  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.744114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.86 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  28.98 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  27.37 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.17 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.12 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  27.55 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  26.41 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  32.65 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  28.69 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  26.92 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.57 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2627  hypothetical protein  31.45 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  32.07 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  29.07 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1186  ApbE family lipoprotein  30.65 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0352655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  23.65 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  27.92 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  26.54 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  29.08 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  30.47 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  28.32 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  29.08 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  29.08 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  29.08 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.62 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  27.5 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  27.76 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0696  ApbE family lipoprotein  26.51 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  29.1 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  29.41 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  29.45 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  27.2 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  24.82 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  25 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2402  ApbE family lipoprotein  28.25 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0984  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>