261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1622 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1622  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 319 aa  610  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.496862  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  53.97 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2585  ApbE-like lipoprotein  49.35 
 
 		 350 aa  212  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.501359  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  43.14 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  41.99 
 
 		 309 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  40.4 
 
 		 313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  41.01 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  38.75 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  36.74 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  39.33 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  31.15 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  29.24 
 
 		 300 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  31.07 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  25.35 
 
 		 360 aa  89  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2080  ApbE family lipoprotein  28.48 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.744114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0696  ApbE family lipoprotein  29.63 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  29.53 
 
 		 275 aa  87  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  24.82 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  33.96 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  34.15 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  27.14 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  31.6 
 
 		 379 aa  82.4  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  26.67 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  34.29 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  36.94 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  28.83 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  27.38 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  31.56 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  27.78 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  26.69 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  29.26 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  34.46 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  25.33 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  35.03 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  27.78 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  32.8 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  27.8 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  27.3 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  31.73 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  31.87 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  31.87 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  31.73 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  28.42 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  36.49 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  27.13 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  36.49 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  36.49 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  36.49 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  30.39 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  29.35 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  27.72 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  28.95 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.08 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0695  ApbE-like lipoprotein  26.85 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  27.24 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  28.16 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  26.81 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  23.17 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3004  ApbE-like lipoprotein  35.66 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.3 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  31.47 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  29.96 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  25.64 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  29.14 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.7 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.53 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  26.82 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  30.07 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  26.82 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  26.82 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  26.13 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  26.82 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.31 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  25.16 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2333  ApbE family lipoprotein  31.18 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00261528  normal  0.177607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.78 
 
 		 349 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  23.89 
 
 		 366 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  28.16 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  30.64 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  29.56 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  29.51 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  25.68 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  32.73 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0051  ApbE family lipoprotein  40.28 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.252526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  23.69 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.15 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  27.08 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  22.14 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  23.55 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  27.14 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  26.97 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  27.11 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  27.48 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  23.79 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  24.02 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  28.78 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  26.44 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  26.24 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>