More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12123 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  100 
 
 		 334 aa  685    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  42.69 
 
 		 336 aa  266  5e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  39.31 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  34.81 
 
 		 321 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  34.23 
 
 		 344 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  33.65 
 
 		 347 aa  175  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  32.64 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  31.21 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  31.21 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  31.21 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  31.21 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  32.47 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  30.21 
 
 		 359 aa  169  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  30.21 
 
 		 345 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  34.38 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.55 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.23 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  31.86 
 
 		 344 aa  165  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.43 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  32.85 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  32.62 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  31.18 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.13 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.01 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  30.41 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  32 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.93 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  30.3 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  30.3 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  29.85 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  31.97 
 
 		 370 aa  159  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  29.68 
 
 		 321 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  29.7 
 
 		 374 aa  158  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.72 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2110  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.48 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.1 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  31.23 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  30.09 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2431  ApbE-like lipoprotein  34.95 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  29.7 
 
 		 347 aa  155  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.23 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  33.64 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.68 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.5 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  31.65 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3291  ApbE family lipoprotein  30.14 
 
 		 330 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238915  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.88 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.19 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0695  ApbE-like lipoprotein  30.21 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.74 
 
 		 348 aa  149  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.96 
 
 		 343 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  29.02 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  27.51 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.72 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  29.54 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.48 
 
 		 361 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  30.47 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  27.15 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  29.02 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0092  ApbE family lipoprotein  33.45 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  30.33 
 
 		 354 aa  142  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  31.56 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  28.92 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  27.76 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  29.18 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  28.29 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  30.28 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0899  ApbE family protein  27.94 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.624097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  29.43 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  28.31 
 
 		 342 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  29.6 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  28.05 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  29.33 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.02 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  29 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.16 
 
 		 351 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.85 
 
 		 351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.53 
 
 		 351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  30.69 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  30.32 
 
 		 340 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0298  hypothetical protein  31.13 
 
 		 392 aa  132  6e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.343578 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.53 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  27.53 
 
 		 351 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  27.53 
 
 		 351 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  27.53 
 
 		 351 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  31.39 
 
 		 342 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.53 
 
 		 351 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.53 
 
 		 351 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.53 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  28.09 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  29.9 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  27.78 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  27.78 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  30.42 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  28.57 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  29.9 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  29.07 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  28.41 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>