More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1186 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1186  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 314 aa  633  1e-180  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0352655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  36.17 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  32.95 
 
 		 329 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  37.13 
 
 		 417 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  35.68 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  31.8 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  36.22 
 
 		 355 aa  125  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  31.95 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30.83 
 
 		 343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  32.16 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  34.33 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  33.09 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.6 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  41.18 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  33.09 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  32.74 
 
 		 350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  29.12 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  32.88 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  31.88 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  27.64 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  34.41 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  31.42 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0905  ApbE family lipoprotein  29.06 
 
 		 406 aa  109  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  29.54 
 
 		 380 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  28.84 
 
 		 337 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  34.41 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.82 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  28.57 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  27.44 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  30.59 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  27.87 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  31.43 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  28.78 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  31.87 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.57 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  31 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  32.47 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  32.85 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.27 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  32.55 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.02 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  31.71 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3168  ApbE family lipoprotein  34.16 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0349  thiamine biosynthesis lipoprotein, putative  28.82 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  30.04 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  27.61 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  34.05 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  29.18 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  28.79 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.15 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.43 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  36.51 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.74 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  25.8 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  27.6 
 
 		 338 aa  99.4  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.55 
 
 		 347 aa  99  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0984  ApbE family lipoprotein  32.64 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  33.93 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  30.66 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  33.62 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.47 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  27.34 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  29.47 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  31.84 
 
 		 379 aa  97.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  27.08 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  27.08 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  29.47 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  29.33 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  27.08 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  33.94 
 
 		 345 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  27.08 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.1 
 
 		 363 aa  97.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  31.25 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  27.46 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  30.14 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3326  hypothetical protein  35.11 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128315 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  26.32 
 
 		 389 aa  96.3  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  27.17 
 
 		 374 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  28.27 
 
 		 348 aa  95.9  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  29.67 
 
 		 326 aa  95.9  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  26.91 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.05 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  35.08 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  26.18 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  27.73 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  30.8 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  29.59 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  29.15 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.75 
 
 		 361 aa  94  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6013  nitrous oxide reductase accessory protein NosX (required for nitrous oxide reduction), ApbE-like lipoprotein  31.66 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279768  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  33.09 
 
 		 365 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  32.71 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  25.45 
 
 		 370 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  26.88 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  33.09 
 
 		 368 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  26.18 
 
 		 374 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4214  ApbE family lipoprotein  33.07 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.15 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>