298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3326 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3326  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128315 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4214  ApbE family lipoprotein  57.39 
 
 		 304 aa  275  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3199  putative nitrous-oxide reductase protein NosX  51.17 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3168  ApbE family lipoprotein  45.83 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  41.46 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  45.39 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2856  ApbE family lipoprotein  42.86 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  39.71 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  41.95 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4341  ApbE family lipoprotein  40.99 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2485  ApbE family lipoprotein  42.57 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0685  ApbE family lipoprotein  43.28 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0743531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6013  nitrous oxide reductase accessory protein NosX (required for nitrous oxide reduction), ApbE-like lipoprotein  40.33 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279768  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4867  ApbE family lipoprotein  39.64 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.1173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  34.09 
 
 		 344 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1333  ApbE family lipoprotein  38.57 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.254528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2415  ApbE family lipoprotein  41.45 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1534  ApbE family lipoprotein  38.21 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  40 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  35.14 
 
 		 337 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  32.59 
 
 		 344 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  30.88 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  38.01 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  34.95 
 
 		 336 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  30.56 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.22 
 
 		 357 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  31.85 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6245  ApbE family lipoprotein  38.64 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  30.77 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  28.94 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  32.91 
 
 		 345 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  29.21 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  32.97 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  28.74 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1186  ApbE family lipoprotein  35.11 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0352655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.22 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 		 362 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  32.32 
 
 		 306 aa  96.3  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  31.97 
 
 		 335 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  27.03 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  33.46 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  34.17 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  34.89 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  29.31 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  26.87 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  33.81 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  33.97 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  26.67 
 
 		 334 aa  92.8  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  33.59 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  28.99 
 
 		 347 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  33.59 
 
 		 301 aa  92.4  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  30.21 
 
 		 341 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  31.36 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  33.59 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  32.5 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  34.81 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  31.91 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  36.02 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.98 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  30.26 
 
 		 332 aa  89.4  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  30.34 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.17 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0298  hypothetical protein  27.11 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.343578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  27.69 
 
 		 336 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  26.57 
 
 		 329 aa  86.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  31.7 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.87 
 
 		 337 aa  86.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  30.2 
 
 		 355 aa  86.3  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 386 aa  86.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  24.22 
 
 		 342 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  26.59 
 
 		 345 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0092  ApbE family lipoprotein  27.49 
 
 		 391 aa  85.9  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  30.86 
 
 		 342 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  33.73 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.64 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  31.54 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  29.01 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  24.32 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  27.11 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  32.21 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  30.53 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  31.92 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  25.27 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  27.33 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  26.58 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  27.47 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  31.91 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  32.3 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  29.33 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  25 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  28.67 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  32.17 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  31.4 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  21.77 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.18 
 
 		 349 aa  79  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  33.67 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  33.92 
 
 		 379 aa  79  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  30.77 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.37 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>