More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3618 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 320 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4867  ApbE family lipoprotein  60.12 
 
 		 324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.1173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1534  ApbE family lipoprotein  63.48 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1333  ApbE family lipoprotein  63.14 
 
 		 325 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.254528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2415  ApbE family lipoprotein  62.46 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  43.6 
 
 		 344 aa  245  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  47.78 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  41.34 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6245  ApbE family lipoprotein  50.22 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  38.91 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  42.37 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  37.54 
 
 		 344 aa  172  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.22 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4214  ApbE family lipoprotein  44.53 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  40.47 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3168  ApbE family lipoprotein  40.5 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6013  nitrous oxide reductase accessory protein NosX (required for nitrous oxide reduction), ApbE-like lipoprotein  37.1 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279768  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2856  ApbE family lipoprotein  38.38 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  34.91 
 
 		 342 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  32.41 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4341  ApbE family lipoprotein  36.76 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.65 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  40.21 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  29.93 
 
 		 360 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  28.67 
 
 		 350 aa  132  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.5 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  29.33 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3326  hypothetical protein  41.74 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  30.55 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  28.66 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  32.81 
 
 		 347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  33.46 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  38.65 
 
 		 342 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  35.48 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  29.39 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  30.45 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3199  putative nitrous-oxide reductase protein NosX  44.26 
 
 		 302 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  34.91 
 
 		 336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.98 
 
 		 335 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  36.9 
 
 		 332 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  35.42 
 
 		 332 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  28.22 
 
 		 381 aa  123  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  35.42 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  33.22 
 
 		 341 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  31.7 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  32.21 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  28.67 
 
 		 323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  34.15 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  30.59 
 
 		 341 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.17 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  28.43 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  35.06 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  27.82 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.27 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0685  ApbE family lipoprotein  37.55 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0743531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  36.52 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.48 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  27.96 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  32.29 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  31.84 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.97 
 
 		 337 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  40.08 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  29.31 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  30.46 
 
 		 346 aa  112  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  36.52 
 
 		 326 aa  112  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.5 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.94 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  30.23 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  31.02 
 
 		 349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  32.65 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  36.28 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  27.03 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  34.71 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  36.68 
 
 		 386 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.47 
 
 		 349 aa  110  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  32.61 
 
 		 351 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  26.37 
 
 		 330 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  31.14 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  37.36 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  29.97 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.87 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2485  ApbE family lipoprotein  38.61 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  30 
 
 		 379 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  30.1 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  30.96 
 
 		 345 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  30.96 
 
 		 359 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.96 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.25 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  28.81 
 
 		 337 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  35.14 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.11 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  27.52 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.41 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  37.63 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.12 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.53 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.97 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>