More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0309 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  100 
 
 		 337 aa  697    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  36.02 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  36.02 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.02 
 
 		 331 aa  195  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  35.58 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  36.05 
 
 		 336 aa  188  9e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  31.02 
 
 		 341 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.99 
 
 		 349 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  35.08 
 
 		 341 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  38.28 
 
 		 350 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.52 
 
 		 334 aa  175  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  30.95 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  31.32 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.91 
 
 		 353 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.33 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.44 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  32.8 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.87 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  31.79 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  31.17 
 
 		 344 aa  169  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  31.56 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0092  ApbE family lipoprotein  32.43 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.65 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  30.79 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  31.56 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  31.56 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  31.1 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.12 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  32.72 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.15 
 
 		 347 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  33.23 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.01 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.12 
 
 		 351 aa  165  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  30.12 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  30.12 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.12 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.41 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  34.15 
 
 		 349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  32.89 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  30.12 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.12 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.12 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2431  ApbE-like lipoprotein  33.02 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.82 
 
 		 351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  32.38 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.12 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.41 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  33.23 
 
 		 345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  31.56 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.41 
 
 		 350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.41 
 
 		 350 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  30.59 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.52 
 
 		 349 aa  162  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.41 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  31.04 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  31.04 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  31.04 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  31.04 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  32.39 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  31.19 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2110  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.42 
 
 		 382 aa  159  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  33.44 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  30.97 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  30.63 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  31.86 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.96 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.62 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  31.53 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  32.98 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  40.35 
 
 		 348 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  30.77 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  35.2 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  36 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.28 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  33.44 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  29.76 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  33.21 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0695  ApbE-like lipoprotein  33.83 
 
 		 337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  30.24 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  29.9 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  36.44 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  38.76 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  32.39 
 
 		 362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  29.86 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  32.13 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.19 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  28.57 
 
 		 371 aa  129  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  34.6 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  31.45 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  32.03 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  31.05 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  25.95 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  33.49 
 
 		 308 aa  126  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  28.62 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  28.63 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  27.97 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  27.84 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  36.2 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  31.6 
 
 		 341 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>