More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2110 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_2110  thiamine biosynthesis lipoprotein  100 
 
 
382 aa  782    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2431  ApbE-like lipoprotein  91.88 
 
 
382 aa  726    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0092  ApbE family lipoprotein  61.13 
 
 
391 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  40.51 
 
 
343 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  41.01 
 
 
370 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  36.99 
 
 
338 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  37.28 
 
 
343 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  37.58 
 
 
338 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  37.97 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.72 
 
 
349 aa  199  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  38.87 
 
 
344 aa  199  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  37.69 
 
 
367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  36.96 
 
 
338 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  37.2 
 
 
334 aa  196  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  39.72 
 
 
344 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  36.62 
 
 
341 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  37.87 
 
 
355 aa  192  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  37.12 
 
 
379 aa  192  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  36.88 
 
 
338 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  36.92 
 
 
359 aa  189  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  35.13 
 
 
341 aa  189  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  37.24 
 
 
345 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.15 
 
 
331 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.82 
 
 
349 aa  186  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  33.63 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.98 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  33.63 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  33.63 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  33.63 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  34.43 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  35.51 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  37.29 
 
 
337 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.27 
 
 
349 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  33.82 
 
 
347 aa  182  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  37.54 
 
 
345 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  33.79 
 
 
338 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  33.74 
 
 
374 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  37.03 
 
 
343 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  33.74 
 
 
374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.72 
 
 
350 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  33.74 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  36.67 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  36.48 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.29 
 
 
361 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  36.63 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  30.38 
 
 
352 aa  172  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0695  ApbE-like lipoprotein  34.36 
 
 
337 aa  172  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  33.54 
 
 
332 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  32.17 
 
 
332 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  33.23 
 
 
332 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  33.24 
 
 
349 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  35.64 
 
 
342 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  33.88 
 
 
362 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  34.97 
 
 
343 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  33.22 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  34.54 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.94 
 
 
353 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  38.41 
 
 
348 aa  162  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  34.54 
 
 
348 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  32.69 
 
 
321 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.42 
 
 
337 aa  159  9e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  32.93 
 
 
323 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  34.48 
 
 
334 aa  158  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  32.5 
 
 
349 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  28.29 
 
 
354 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.9 
 
 
350 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.9 
 
 
350 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0427  ApbE family lipoprotein  35.25 
 
 
287 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127952  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.6 
 
 
337 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.9 
 
 
350 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  33.23 
 
 
341 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.9 
 
 
350 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.9 
 
 
350 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.48 
 
 
351 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.48 
 
 
351 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1900  ApbE-like lipoprotein  29.2 
 
 
327 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  0.0133899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  32.47 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  32.79 
 
 
326 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.13 
 
 
351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  30.21 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  30.21 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.21 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  32.23 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  30.21 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.21 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.21 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  28.92 
 
 
331 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0984  ApbE family lipoprotein  33.76 
 
 
323 aa  146  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.174547 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  32.13 
 
 
329 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  31.93 
 
 
341 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2105  thiamine biosynthesis lipoprotein, putative  28.8 
 
 
343 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  30.06 
 
 
335 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3291  ApbE family lipoprotein  31.12 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238915  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  31.67 
 
 
326 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  34.74 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.91 
 
 
351 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  30.91 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0899  ApbE family protein  30.15 
 
 
365 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.624097  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  30.13 
 
 
340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  29.93 
 
 
327 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>