More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0280 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0280  nosX protein  100 
 
 		 330 aa  675    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4341  ApbE family lipoprotein  65.24 
 
 		 336 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  50.8 
 
 		 332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  49.85 
 
 		 333 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  48.46 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6013  nitrous oxide reductase accessory protein NosX (required for nitrous oxide reduction), ApbE-like lipoprotein  45.31 
 
 		 332 aa  262  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279768  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2856  ApbE family lipoprotein  45.48 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4214  ApbE family lipoprotein  42.22 
 
 		 304 aa  205  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3168  ApbE family lipoprotein  37.66 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3326  hypothetical protein  39.71 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3199  putative nitrous-oxide reductase protein NosX  41.6 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2485  ApbE family lipoprotein  36.54 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  37.39 
 
 		 327 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0685  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0743531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1333  ApbE family lipoprotein  37.66 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.254528 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2415  ApbE family lipoprotein  36.82 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4867  ApbE family lipoprotein  36.48 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.1173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1534  ApbE family lipoprotein  38.94 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  28.66 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  31.36 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  33.22 
 
 		 344 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  30.14 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  32.51 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.45 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  33.59 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  32.02 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  29.14 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  28.84 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  27 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  31.89 
 
 		 347 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6245  ApbE family lipoprotein  36.82 
 
 		 264 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  27.7 
 
 		 342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  28.29 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.32 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.33 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  27.4 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  30.93 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.57 
 
 		 349 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  27.92 
 
 		 381 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  33.22 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  30.59 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  32.57 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  27.18 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  29.49 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  29.1 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  32.95 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  32.18 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  28.35 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.62 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  31.12 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.79 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  31.7 
 
 		 386 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  31.48 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  28.51 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  32.06 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  30.27 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  26.36 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  31.06 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  31.44 
 
 		 302 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  33.2 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  31.06 
 
 		 301 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  30.63 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  31.06 
 
 		 301 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  27.91 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  26.22 
 
 		 380 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  27.02 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  24.55 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  26.32 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  29.5 
 
 		 417 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  29.93 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.18 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  27.87 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  29.8 
 
 		 379 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  30.68 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  31.09 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  29.17 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  31.21 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  29.55 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  32.72 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.6 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  32.18 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  32.61 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  31.01 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.47 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  26.07 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  27.3 
 
 		 348 aa  95.9  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  30.86 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.44 
 
 		 351 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  28.03 
 
 		 371 aa  94.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  31.05 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  30.68 
 
 		 339 aa  94.4  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.44 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0511  ApbE family lipoprotein  26.22 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  28.72 
 
 		 298 aa  94.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  31.42 
 
 		 347 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  28.81 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>